SIRPA

SIRPA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JJS, 2JJT, 2UV3, 2WNG, 4CMM
Ідентифікатори
Символи	SIRPA, BIT, CD172A, MFR, MYD-1, P84, PTPNS1, SHPS1, SIRP, Signal-regulatory protein alpha, signal regulatory protein alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 602461 MGI: 108563 HomoloGene: 7246 GeneCards: SIRPA
Онтологія гена Молекулярна функція • SH3 domain binding • protein phosphatase binding • GO:0005083 GTPase regulator activity • protein binding involved in heterotypic cell-cell adhesion • cell-cell adhesion mediator activity • protein antigen binding • protein tyrosine kinase binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • екзосома • мембрана • tertiary granule membrane • ficolin-1-rich granule membrane • integral component of plasma membrane • cell surface Біологічний процес • адгезія клітин • leukocyte migration • neutrophil degranulation • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation • регуляція експресії генів • cell migration • positive regulation of cell-cell adhesion • regulation of interferon-gamma production • regulation of interleukin-1 beta production • regulation of interleukin-6 production • regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of interferon-beta production • negative regulation of interleukin-6 production • negative regulation of tumor necrosis factor production • heterotypic cell-cell adhesion • monocyte extravasation • negative regulation of nitric oxide biosynthetic process • regulation of nitric oxide biosynthetic process • negative regulation of JNK cascade • negative regulation of inflammatory response • negative regulation of phagocytosis • positive regulation of phagocytosis • GO:0048552 regulation of catalytic activity • positive regulation of T cell activation • cellular response to hydrogen peroxide • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to lipopolysaccharide • cellular response to interferon-gamma • cellular response to interleukin-1 • cellular response to interleukin-12 • negative regulation of macrophage inflammatory protein 1 alpha production • negative regulation of chemokine (C-C motif) ligand 5 production • cell-cell adhesion • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • negative regulation of I-kappaB phosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140885	19261
Ensembl	ENSG00000198053	ENSMUSG00000037902
UniProt	P78324	P97797
RefSeq (мРНК)	NM_001040022 NM_001040023 NM_080792 NM_001330728	NM_001177646 NM_001177647 NM_001291019 NM_001291020 NM_001291021 NM_001291022 NM_007547 NM_001355158 NM_001355160
RefSeq (білок)	NP_001035111 NP_001035112 NP_001317657 NP_542970	NP_001171118 NP_001277948 NP_001277949 NP_001277950 NP_001277951 NP_031573 NP_001342087 NP_001342089
Локус (UCSC)	Хр. 20: 1.89 – 1.94 Mb	Хр. 2: 129.43 – 129.47 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIRPA (англ. Signal regulatory protein alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 504 амінокислот, а молекулярна маса — 54 967[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPAGPAPGR		LGPLLCLLLA		ASCAWSGVAG		EEELQVIQPD		KSVLVAAGET
ATLRCTATSL		IPVGPIQWFR		GAGPGRELIY		NQKEGHFPRV		TTVSDLTKRN
NMDFSIRIGN		ITPADAGTYY		CVKFRKGSPD		DVEFKSGAGT		ELSVRAKPSA
PVVSGPAARA		TPQHTVSFTC		ESHGFSPRDI		TLKWFKNGNE		LSDFQTNVDP
VGESVSYSIH		STAKVVLTRE		DVHSQVICEV		AHVTLQGDPL		RGTANLSETI
RVPPTLEVTQ		QPVRAENQVN		VTCQVRKFYP		QRLQLTWLEN		GNVSRTETAS
TVTENKDGTY		NWMSWLLVNV		SAHRDDVKLT		CQVEHDGQPA		VSKSHDLKVS
AHPKEQGSNT		AAENTGSNER		NIYIVVGVVC		TLLVALLMAA		LYLVRIRQKK
AQGSTSSTRL		HEPEKNAREI		TQDTNDITYA		DLNLPKGKKP		APQAAEPNNH
TEYASIQTSP		QPASEDTLTY		ADLDMVHLNR		TPKQPAPKPE		PSFSEYASVQ
VPRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• Sano S., Ohnishi H., Kubota M. (1999). Gene structure of mouse BIT/SHPS-1. Biochem. J. 344: 667—675. PMID 10585853 DOI:10.1042/bj3440667
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brooke G.P., Parsons K.R., Howard C.J. (1998). Cloning of two members of the SIRP alpha family of protein tyrosine phosphatase binding proteins in cattle that are expressed on monocytes and a subpopulation of dendritic cells and which mediate binding to CD4 T cells. Eur. J. Immunol. 28: 1—11. PMID 9485180 DOI:10.1002/(SICI)1521-4141(199801)28:01<1::AID-IMMU1>3.3.CO;2-M
• Stofega M.R., Argetsinger L.S., Wang H., Ullrich A., Carter-Su C. (2000). Negative regulation of growth hormone receptor/JAK2 signaling by signal regulatory protein alpha. J. Biol. Chem. 275: 28222—28229. PMID 10842184 DOI:10.1074/jbc.M004238200
• Hatherley D., Harlos K., Dunlop D.C., Stuart D.I., Barclay A.N. (2007). The structure of the macrophage signal regulatory protein alpha (SIRPalpha) inhibitory receptor reveals a binding face reminiscent of that used by T cell receptors. J. Biol. Chem. 282: 14567—14575. PMID 17369261 DOI:10.1074/jbc.M611511200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9662 (англ.) . Архів оригіналу за 3 лютого 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-02-03 у Wayback Machine.]
4. UniProt, P78324 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 20

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»