TNFSF13B

TNFSF13B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1JH5, 1KD7, 1KXG, 1OQD, 1OQE, 1OSG, 3V56, 4V46, 4ZCH
Ідентифікатори
Символи	TNFSF13B, BAFF, BLYS, CD257, DTL, TALL-1, TALL1, THANK, TNFSF20, ZTNF4, TNLG7A, tumor necrosis factor superfamily member 13b, TNF superfamily member 13b
Зовнішні ІД	OMIM: 603969 MGI: 1344376 HomoloGene: 48443 GeneCards: TNFSF13B
Реагує на сполуку
belimumab[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • tumor necrosis factor receptor binding • cytokine activity • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • perinuclear region of cytoplasm • extracellular region • клітинна мембрана • мембрана • міжклітинний простір Біологічний процес • проліферація • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell population proliferation • процес імунної системи • regulation of immune response • T cell costimulation • B cell homeostasis • B cell costimulation • positive regulation of T cell proliferation • positive regulation of B cell proliferation • positive regulation of germinal center formation • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10673	24099
Ensembl	ENSG00000102524	ENSMUSG00000031497
UniProt	Q9Y275	Q9WU72
RefSeq (мРНК)	NM_001145645 NM_006573	NM_033622 NM_001347309
RefSeq (білок)	NP_001139117 NP_006564	NP_001334238 NP_296371
Локус (UCSC)	Хр. 13: 108.25 – 108.31 Mb	Хр. 8: 10.06 – 10.09 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFSF13B (англ. TNF superfamily member 13b) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 285 амінокислот, а молекулярна маса — 31 223[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDDSTEREQS		RLTSCLKKRE		EMKLKECVSI		LPRKESPSVR		SSKDGKLLAA
TLLLALLSCC		LTVVSFYQVA		ALQGDLASLR		AELQGHHAEK		LPAGAGAPKA
GLEEAPAVTA		GLKIFEPPAP		GEGNSSQNSR		NKRAVQGPEE		TVTQDCLQLI
ADSETPTIQK		GSYTFVPWLL		SFKRGSALEE		KENKILVKET		GYFFIYGQVL
YTDKTYAMGH		LIQRKKVHVF		GDELSLVTLF		RCIQNMPETL		PNNSCYSAGI
AKLEEGDELQ		LAIPRENAQI		SLDGDVTFFG		ALKLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Gavin A.L., Ait-Azzouzene D., Ware C.F., Nemazee D. (2003). DeltaBAFF, an alternate splice isoform that regulates receptor binding and biopresentation of the B cell survival cytokine, BAFF. J. Biol. Chem. 278: 38220—38228. PMID 12867412 DOI:10.1074/jbc.M306852200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shu H.-B., Hu W.-H., Johnson H. (1999). TALL-1 is a novel member of the TNF family that is down-regulated by mitogens. J. Leukoc. Biol. 65: 680—683. PMID 10331498

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з TNFSF13B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11929 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-08-17 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q9Y275 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 13

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»