CD209

CD209
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1K9I, 1SL4, 1SL5, 2B6B, 2IT5, 2IT6, 2XR5, 2XR6
Ідентифікатори
Символи	CD209, CDSIGN, CLEC4L, DC-SIGN, DC-SIGN1, CD209 molecule, hDC-SIGN
Зовнішні ІД	OMIM: 604672 MGI: 2157948 HomoloGene: 128353 GeneCards: CD209
Онтологія гена Молекулярна функція • peptide antigen binding • virus receptor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mannose binding • virion binding • carbohydrate binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • extracellular region • cell surface • екзосома • external side of plasma membrane • host cell • клітинна мембрана Біологічний процес • leukocyte cell-cell adhesion • cell-cell recognition • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of T cell proliferation • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • GO:0007243 intracellular signal transduction • antigen processing and presentation • ендоцитоз • адаптивна імунна відповідь • процес імунної системи • viral genome replication • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • peptide antigen transport • адгезія клітин • modulation by virus of host process • viral entry into host cell • GO:0022415 viral process • virion attachment to host cell • вроджений імунітет • positive regulation of T cell proliferation • B cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	30835	170780
Ensembl	ENSG00000090659	ENSMUSG00000040197
UniProt	Q9NNX6	Q91ZW7
RefSeq (мРНК)	NM_001144893 NM_001144894 NM_001144895 NM_001144896 NM_001144897 NM_001144899 NM_021155	NM_130905
RefSeq (білок)	NP_001138365 NP_001138366 NP_001138367 NP_001138368 NP_001138369 NP_001138371 NP_066978	NP_570975
Локус (UCSC)	Хр. 19: 7.74 – 7.75 Mb	Хр. 8: 3.9 – 3.9 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CD209 (англ. CD209 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 404 амінокислот, а молекулярна маса — 45 775[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSDSKEPRLQ		QLGLLEEEQL		RGLGFRQTRG		YKSLAGCLGH		GPLVLQLLSF
TLLAGLLVQV		SKVPSSISQE		QSRQDAIYQN		LTQLKAAVGE		LSEKSKLQEI
YQELTQLKAA		VGELPEKSKL		QEIYQELTRL		KAAVGELPEK		SKLQEIYQEL
TWLKAAVGEL		PEKSKMQEIY		QELTRLKAAV		GELPEKSKQQ		EIYQELTRLK
AAVGELPEKS		KQQEIYQELT		RLKAAVGELP		EKSKQQEIYQ		ELTQLKAAVE
RLCHPCPWEW		TFFQGNCYFM		SNSQRNWHDS		ITACKEVGAQ		LVVIKSAEEQ
NFLQLQSSRS		NRFTWMGLSD		LNQEGTWQWV		DGSPLLPSFK		QYWNRGEPNN
VGEEDCAEFS		GNGWNDDKCN		LAKFWICKKS		AASCSRDEEQ		FLSPAPATPN
PPPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Curtis B.M., Scharnowske S., Watson A.J. (1992). Sequence and expression of a membrane-associated C-type lectin that exhibits CD4-independent binding of human immunodeficiency virus envelope glycoprotein gp 120. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 8356—8360. PMID 1518869 DOI:10.1073/pnas.89.17.8356
• Soilleux E.J., Barten R., Trowsdale J. (2000). DC-SIGN, a related gene, DC-SIGNR, and CD23 form a cluster on 19p13. J. Immunol. 165: 2937—2942. PMID 10975799 DOI:10.4049/jimmunol.165.6.2937
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mitchell D.A., Fadden A.J., Drickamer K. (2001). A novel mechanism of carbohydrate recognition by the C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR. Subunit organization and binding to multivalent ligands. J. Biol. Chem. 276: 28939—28945. PMID 11384997 DOI:10.1074/jbc.M104565200
• Kwon D.S., Gregorio G., Bitton N., Hendrickson W.A., Littman D.R. (2002). DC-SIGN-mediated internalization of HIV is required for trans-enhancement of T cell infection. Immunity. 16: 135—144. PMID 11825572 DOI:10.1016/S1074-7613(02)00259-5
• Nobile C., Moris A., Porrot F., Sol-Foulon N., Schwartz O. (2003). Inhibition of human immunodeficiency virus type 1 Env-mediated fusion by DC-SIGN. J. Virol. 77: 5313—5323. PMID 12692233 DOI:10.1128/JVI.77.9.5313-5323.2003

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1641 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
4. UniProt, Q9NNX6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»