SELE

SELE
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1ESL, 1G1T, 4C16, 4CSY
Ідентифікатори
Символи	SELE, CD62E, ELAM, ELAM1, ESEL, LECAM2, selectin E, selectin-e
Зовнішні ІД	OMIM: 131210 MGI: 98278 HomoloGene: 389 GeneCards: SELE
Реагує на сполуку
bimosiamose, rivipansel[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • phospholipase binding • oligosaccharide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane signaling receptor activity • carbohydrate binding • sialic acid binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • cortical cytoskeleton • клітинна мембрана • perinuclear region of cytoplasm • caveola • membrane raft • clathrin-coated pit • міжклітинний простір • integral component of plasma membrane Біологічний процес • leukocyte cell-cell adhesion • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • response to interleukin-1 • positive regulation of receptor internalization • actin filament-based process • leukocyte migration involved in inflammatory response • activation of phospholipase C activity • response to tumor necrosis factor • response to lipopolysaccharide • адгезія клітин • regulation of inflammatory response • leukocyte tethering or rolling • inflammatory response • leukocyte migration • calcium-mediated signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6401	20339
Ensembl	ENSG00000007908	ENSMUSG00000026582
UniProt	P16581	Q00690
RefSeq (мРНК)	NM_000450	NM_011345
RefSeq (білок)	NP_000441	NP_035475
Локус (UCSC)	Хр. 1: 169.72 – 169.76 Mb	Хр. 1: 163.88 – 163.89 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SELE (англ. Selectin E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 610 амінокислот, а молекулярна маса — 66 655[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MIASQFLSAL		TLVLLIKESG		AWSYNTSTEA		MTYDEASAYC		QQRYTHLVAI
QNKEEIEYLN		SILSYSPSYY		WIGIRKVNNV		WVWVGTQKPL		TEEAKNWAPG
EPNNRQKDED		CVEIYIKREK		DVGMWNDERC		SKKKLALCYT		AACTNTSCSG
HGECVETINN		YTCKCDPGFS		GLKCEQIVNC		TALESPEHGS		LVCSHPLGNF
SYNSSCSISC		DRGYLPSSME		TMQCMSSGEW		SAPIPACNVV		ECDAVTNPAN
GFVECFQNPG		SFPWNTTCTF		DCEEGFELMG		AQSLQCTSSG		NWDNEKPTCK
AVTCRAVRQP		QNGSVRCSHS		PAGEFTFKSS		CNFTCEEGFM		LQGPAQVECT
TQGQWTQQIP		VCEAFQCTAL		SNPERGYMNC		LPSASGSFRY		GSSCEFSCEQ
GFVLKGSKRL		QCGPTGEWDN		EKPTCEAVRC		DAVHQPPKGL		VRCAHSPIGE
FTYKSSCAFS		CEEGFELHGS		TQLECTSQGQ		WTEEVPSCQV		VKCSSLAVPG
KINMSCSGEP		VFGTVCKFAC		PEGWTLNGSA		ARTCGATGHW		SGLLPTCEAP
TESNIPLVAG		LSAAGLSLLT		LAPFLLWLRK		CLRKAKKFVP		ASSCQSLESD
GSYQKPSYIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Bevilacqua M.P., Stengelin S., Gimbrone M.A. Jr., Seed B. (1989). Endothelial leukocyte adhesion molecule 1: an inducible receptor for neutrophils related to complement regulatory proteins and lectins. Science. 243: 1160—1165. PMID 2466335 DOI:10.1126/science.2466335
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kerr S.C., Fieger C.B., Snapp K.R., Rosen S.D. (2008). Endoglycan, a member of the CD34 family of sialomucins, is a ligand for the vascular selectins. J. Immunol. 181: 1480—1490. PMID 18606703 DOI:10.4049/jimmunol.181.2.1480
• Mills A. (1993). Modelling the carbohydrate recognition domain of human E-selectin. FEBS Lett. 319: 5—11. PMID 7681016 DOI:10.1016/0014-5793(93)80026-Q
• Somers W.S., Tang J., Shaw G.D., Camphausen R.T. (2000). Insights into the molecular basis of leukocyte tethering and rolling revealed by structures of P- and E-selectin bound to SLe(X) and PSGL-1. Cell. 103: 467—479. PMID 11081633 DOI:10.1016/S0092-8674(00)00138-0
• Wenzel K., Ernst M., Rohde K., Baumann G., Speer A. (1996). DNA polymorphisms in adhesion molecule genes -- a new risk factor for early atherosclerosis. Hum. Genet. 97: 15—20. PMID 8557254 DOI:10.1007/BF00218826

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з SELE переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10718 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
5. UniProt, P16581 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»