uk CD6

CD6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5A2E
Ідентифікатори
Символи	CD6, TP120, CD6 molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 186720 MGI: 103566 HomoloGene: 4893 GeneCards: CD6
Пов'язані генетичні захворювання
	розсіяний склероз
Онтологія гена
Молекулярна функція	• lipopolysaccharide binding; • lipoteichoic acid binding; • scavenger receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • intrinsic component of plasma membrane; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • T cell receptor complex; • extracellular region; • immunological synapse; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • адаптивна імунна відповідь; • процес імунної системи; • acute inflammatory response to antigenic stimulus; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • response to lipopolysaccharide; • адгезія клітин; • positive regulation of T cell proliferation; • вроджений імунітет; • immunological synapse formation; • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway; • vesicle-mediated transport; • ендоцитоз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	923
	12511
	ENSG00000013725
	ENSMUSG00000024670
	P30203
	Q61003
	NM_001254750; NM_001254751; NM_006725
	NM_001037801; NM_009852
	NP_001241679; NP_001241680; NP_006716
	NP_001032890; NP_033982
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD6 (англ. CD6 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 668 амінокислот, а молекулярна маса — 71 801^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWLFFGITGL	LTAALSGHPS	PAPPDQLNTS	SAESELWEPG	ERLPVRLTNG
SSSCSGTVEV	RLEASWEPAC	GALWDSRAAE	AVCRALGCGG	AEAASQLAPP
TPELPPPPAA	GNTSVAANAT	LAGAPALLCS	GAEWRLCEVV	EHACRSDGRR
ARVTCAENRA	LRLVDGGGAC	AGRVEMLEHG	EWGSVCDDTW	DLEDAHVVCR
QLGCGWAVQA	LPGLHFTPGR	GPIHRDQVNC	SGAEAYLWDC	PGLPGQHYCG
HKEDAGAVCS	EHQSWRLTGG	ADRCEGQVEV	HFRGVWNTVC	DSEWYPSEAK
VLCQSLGCGT	AVERPKGLPH	SLSGRMYYSC	NGEELTLSNC	SWRFNNSNLC
SQSLAARVLC	SASRSLHNLS	TPEVPASVQT	VTIESSVTVK	IENKESRELM
LLIPSIVLGI	LLLGSLIFIA	FILLRIKGKY	ALPVMVNHQH	LPTTIPAGSN
SYQPVPITIP	KEVFMLPIQV	QAPPPEDSDS	GSDSDYEHYD	FSAQPPVALT
TFYNSQRHRV	TDEEVQQSRF	QMPPLEEGLE	ELHASHIPTA	NPGHCITDPP
SLGPQYHPRS	NSESSTSSGE	DYCNSPKSKL	PPWNPQVFSS	ERSSFLEQPP
NLELAGTQPA	FSAGPPADDS	SSTSSGEWYQ	NFQPPPQPPS	EEQFGCPGSP
SPQPDSTDND	DYDDISAA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, адаптивний імунітет, імунітет, вроджений імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

Aruffo A., Melnick M.B., Linsley P.S., Seed B. (1991). The lymphocyte glycoprotein CD6 contains a repeated domain structure characteristic of a new family of cell surface and secreted proteins. J. Exp. Med. 174: 949—952. PMID 1919444 DOI:10.1084/jem.174.4.949
Hassan N.J., Barclay A.N., Brown M.H. (2004). Frontline: Optimal T cell activation requires the engagement of CD6 and CD166. Eur. J. Immunol. 34: 930—940. PMID 15048703 DOI:10.1002/eji.200424856
Swack J.A., Mier J.W., Romain P.L., Hull S.R., Rudd C.E. (1991). Biosynthesis and post-translational modification of CD6, a T cell signal-transducing molecule. J. Biol. Chem. 266: 7137—7143. PMID 2016320

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CD6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1691 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P30203 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CD6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1691 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P30203 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]