CD33

CD33
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5IHB, 5J06, 5J0B, 6D48, 6D49, 6D4A, 6TL8, 7AW6
Ідентифікатори
Символи	CD33, CD33 molecule, SIGLEC-3, SIGLEC3, p67
Зовнішні ІД	OMIM: 159590 MGI: 99440 HomoloGene: 88651 GeneCards: CD33
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера[1]
Реагує на сполуку
Tenomodulin[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • carbohydrate binding • signaling receptor activity • protein phosphatase binding • sialic acid binding Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • external side of plasma membrane • клітинне ядро • клітинна мембрана • specific granule membrane • tertiary granule membrane • пероксисома • комплекс Ґольджі Біологічний процес • cell-cell signaling • адгезія клітин • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • regulation of immune response • neutrophil degranulation • immune response-inhibiting signal transduction • positive regulation of protein secretion • negative regulation of interleukin-1 beta production • negative regulation of interleukin-8 production • negative regulation of tumor necrosis factor production • negative regulation of calcium ion transport • cell-cell adhesion • positive regulation of protein tyrosine phosphatase activity • negative regulation of monocyte activation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	945	12489
Ensembl	ENSG00000105383	ENSMUSG00000004609
UniProt	P20138	Q63994
RefSeq (мРНК)	NM_001082618 NM_001177608 NM_001772	NM_001111058 NM_021293
RefSeq (білок)	NP_001076087 NP_001171079 NP_001763	NP_001104528 NP_067268
Локус (UCSC)	Хр. 19: 51.23 – 51.24 Mb	Хр. 7: 43.17 – 43.19 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CD33 (англ. CD33 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 364 амінокислот, а молекулярна маса — 39 825[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPLLLLLPLL		WAGALAMDPN		FWLQVQESVT		VQEGLCVLVP		CTFFHPIPYY
DKNSPVHGYW		FREGAIISRD		SPVATNKLDQ		EVQEETQGRF		RLLGDPSRNN
CSLSIVDARR		RDNGSYFFRM		ERGSTKYSYK		SPQLSVHVTD		LTHRPKILIP
GTLEPGHSKN		LTCSVSWACE		QGTPPIFSWL		SAAPTSLGPR		TTHSSVLIIT
PRPQDHGTNL		TCQVKFAGAG		VTTERTIQLN		VTYVPQNPTT		GIFPGDGSGK
QETRAGVVHG		AIGGAGVTAL		LALCLCLIFF		IVKTHRRKAA		RTAVGRNDTH
PTTGSASPKH		QKKSKLHGPT		ETSSCSGAAP		TVEMDEELHY		ASLNFHGMNP
SKDTSTEYSE		VRTQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з лектинами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Yousef G.M., Ordon M.H., Foussias G., Diamandis E.P. (2002). Genomic organization of the siglec gene locus on chromosome 19q13.4 and cloning of two new siglec pseudogenes. Gene. 286: 259—270. PMID 11943481 DOI:10.1016/S0378-1119(02)00432-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ulyanova T., Blasioli J., Woodford-Thomas T.A., Thomas M.L. (1999). The sialoadhesin CD33 is a myeloid-specific inhibitory receptor. Eur. J. Immunol. 29: 3440—3449. PMID 10556798 DOI:10.1002/(SICI)1521-4141(199911)29:11<3440::AID-IMMU3440>3.0.CO;2-C
• Simmons D., Seed B. (1988). Isolation of a cDNA encoding CD33, a differentiation antigen of myeloid progenitor cells. J. Immunol. 141: 2797—2800. PMID 3139766
• Freeman S.D., Kelm S., Barber E.K., Crocker P.R. (1995). Characterization of CD33 as a new member of the sialoadhesin family of cellular interaction molecules. Blood. 85: 2005—2012. PMID 7718872

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з CD33 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з CD33 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1659 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
6. UniProt, P20138 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»