CD180

CD180
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CD180, LY64, Ly78, RP105, CD180 molecule
Зовнішні ІД OMIM: 602226 MGI: 1194924 HomoloGene: 4077 GeneCards: CD180
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_005582
NM_008533
NM_001360519
RefSeq (білок)
NP_005573
NP_032559
NP_001347448
Локус (UCSC) Хр. 5: 67.18 – 67.2 Mb Хр. 13: 102.83 – 102.88 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CD180 (англ. CD180 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 661 амінокислот, а молекулярна маса — 74 179[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAFDVSCFFWVVLFSAGCKVITSWDQMCIEKEANKTYNCENLGLSEIPDT
LPNTTEFLEFSFNFLPTIHNRTFSRLMNLTFLDLTRCQINWIHEDTFQSH
HQLSTLVLTGNPLIFMAETSLNGPKSLKHLFLIQTGISNLEFIPVHNLEN
LESLYLGSNHISSIKFPKDFPARNLKVLDFQNNAIHYISREDMRSLEQAI
NLSLNFNGNNVKGIELGAFDSTIFQSLNFGGTPNLSVIFNGLQNSTTQSL
WLGTFEDIDDEDISSAMLKGLCEMSVESLNLQEHRFSDISSTTFQCFTQL
QELDLTATHLKGLPSGMKGLNLLKKLVLSVNHFDQLCQISAANFPSLTHL
YIRGNVKKLHLGVGCLEKLGNLQTLDLSHNDIEASDCCSLQLKNLSHLQT
LNLSHNEPLGLQSQAFKECPQLELLDLAFTRLHINAPQSPFQNLHFLQVL
NLTYCFLDTSNQHLLAGLPVLRHLNLKGNHFQDGTITKTNLLQTVGSLEV
LILSSCGLLSIDQQAFHSLGKMSHVDLSHNSLTCDSIDSLSHLKGIYLNL
AANSINIISPRLLPILSQQSTINLSHNPLDCTCSNIHFLTWYKENLHKLE
GSEETTCANPPSLRGVKLSDVKLSCGITAIGIFFLIVFLLLLAILLFFAV
KYLLRWKYQHI

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
  • Ohto U., Miyake K., Shimizu T. (2011). Crystal structures of mouse and human RP105/MD-1 complexes reveal unique dimer organization of the toll-like receptor family. J. Mol. Biol. 413: 815—825. PMID 21959264 DOI:10.1016/j.jmb.2011.09.020

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6726 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q99467 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.

Див. також