Ia meraih gelar sarjana dari Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu PolitikUniversitas Nasional. Mengikuti program ekstensi filsafat di Sekolah Tinggi Filsafat (STF) Driyarkara. Kemudian meraih gelar sarjana Magister Ilmu Hukum (MH) dari Universitas Kristen Indonesia (UKI) dilanjutkan meraih gelar Doktor Hukum Tata Negara dari Universitas Kristen Indonesia (UKI) Jakarta.
Saat ini Manuel Kaisiepo adalah Anggota Tim Penasihat Senior Kantor Staf Presiden (KSP) Republik Indonesia 2020 - 2024,[1] dan dosen di Program Doktor Hukum (PDH) Pascasarjana Universitas Kristen Indonesia (UKI) Jakarta.
Manuel Kaisiepo juga menjadi Anggota Dewan Pakar dan Pengurus Aliansi Kebangsaan 2019-sekarang; Anggota Dewan Pertimbangan Gerakan Nasionalis Bhineka; dan Anggota Dewan Pakar FKPPI, 2022.
Pendidikan
Sarjana Muda Hubungan Internasional FISIP UGM (1973–1975)[2]
Menteri Negara Percepatan Pembangunan Kawasan Timur Indonesia Kabinet Gotong Royong (2001–2004)
Dosen Program Magister Ilmu Komunikasi, Universitas Pelita Harapan (UPH); dosen Program Teacher Colleage (TC) FIP - UPH (2008–2013)
Anggota Komisi VII dan VIII DPR RI (2009–2014)
Saat ini menjadi anggota Tim Penasihat Kantor Staf Presiden (KSP) RI 2020
Kegiatan
Ketua Delegasi RI pada KTT Pacific Islands Forum (PIF) di Aiwo, Nauru (Ags. 2001)
Ketua Delegasi RI pada Ministrial Meeting BIMP-EAGA (Brunai, Indonesia, Malaysia, and Philippines-South East Asia Growth Area); sebagai persiapan KTT ASEAN, Oktober 2003 di Denpasar, Bali (Sep. 2013)
Ketua Delegasi Grup Kerja Sama Bilateral (GKSB) Parlemen RI pada pertemuan dengan Parlemen dan Pemerintah Papua Nugini (PNG) di Port Moresby, PNG (Nov. 2013)