TRPM5

TRPM5
Ідентифікатори
Символи	TRPM5, LTRPC5, MTR1, transient receptor potential cation channel subfamily M member 5
Зовнішні ІД	OMIM: 604600 MGI: 1861718 HomoloGene: 22818 GeneCards: TRPM5
Реагує на сполуку
steviol, Rebaudioside A, stevioside, flufenamic acid, гідрон, spermine[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • potassium channel activity • calcium activated cation channel activity • sodium channel activity Клітинна компонента • клітинна мембрана • мембрана • soma • дендрит (нейробіологія) • integral component of membrane Біологічний процес • ion transport • sodium ion transmembrane transport • sensory perception of taste • calcium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • cation transport • regulation of ion transmembrane transport • ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29850	56843
Ensembl	ENSG00000070985	ENSMUSG00000009246
UniProt	Q9NZQ8	Q9JJH7
RefSeq (мРНК)	NM_014555	NM_020277
RefSeq (білок)	NP_055370	NP_064673
Локус (UCSC)	Хр. 11: 2.4 – 2.44 Mb	Хр. 7: 142.62 – 142.65 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRPM5 (англ. Transient receptor potential cation channel subfamily M member 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 165 амінокислот, а молекулярна маса — 131 451[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQDVQGPRPG		SPGDAEDRRE		LGLHRGEVNF		GGSGKKRGKF		VRVPSGVAPS
VLFDLLLAEW		HLPAPNLVVS		LVGEEQPFAM		KSWLRDVLRK		GLVKAAQSTG
AWILTSALRV		GLARHVGQAV		RDHSLASTST		KVRVVAVGMA		SLGRVLHRRI
LEEAQEDFPV		HYPEDDGGSQ		GPLCSLDSNL		SHFILVEPGP		PGKGDGLTEL
RLRLEKHISE		QRAGYGGTGS		IEIPVLCLLV		NGDPNTLERI		SRAVEQAAPW
LILVGSGGIA		DVLAALVNQP		HLLVPKVAEK		QFKEKFPSKH		FSWEDIVRWT
KLLQNITSHQ		HLLTVYDFEQ		EGSEELDTVI		LKALVKACKS		HSQEPQDYLD
ELKLAVAWDR		VDIAKSEIFN		GDVEWKSCDL		EEVMVDALVS		NKPEFVRLFV
DNGADVADFL		TYGRLQELYR		SVSRKSLLFD		LLQRKQEEAR		LTLAGLGTQQ
AREPPAGPPA		FSLHEVSRVL		KDFLQDACRG		FYQDGRPGDR		RRAEKGPAKR
PTGQKWLLDL		NQKSENPWRD		LFLWAVLQNR		HEMATYFWAM		GQEGVAAALA
ACKILKEMSH		LETEAEAARA		TREAKYERLA		LDLFSECYSN		SEARAFALLV
RRNRCWSKTT		CLHLATEADA		KAFFAHDGVQ		AFLTRIWWGD		MAAGTPILRL
LGAFLCPALV		YTNLITFSEE		APLRTGLEDL		QDLDSLDTEK		SPLYGLQSRV
EELVEAPRAQ		GDRGPRAVFL		LTRWRKFWGA		PVTVFLGNVV		MYFAFLFLFT
YVLLVDFRPP		PQGPSGPEVT		LYFWVFTLVL		EEIRQGFFTD		EDTHLVKKFT
LYVGDNWNKC		DMVAIFLFIV		GVTCRMLPSA		FEAGRTVLAM		DFMVFTLRLI
HIFAIHKQLG		PKIIVVERMM		KDVFFFLFFL		SVWLVAYGVT		TQALLHPHDG
RLEWIFRRVL		YRPYLQIFGQ		IPLDEIDEAR		VNCSTHPLLL		EDSPSCPSLY
ANWLVILLLV		TFLLVTNVLL		MNLLIAMFSY		TFQVVQGNAD		MFWKFQRYNL
IVEYHERPAL		APPFILLSHL		SLTLRRVFKK		EAEHKREHLE		RDLPDPLDQK
VVTWETVQKE		NFLSKMEKRR		RDSEGEVLRK		TAHRVDFIAK		YLGGLREQEK
RIKCLESQIN		YCSVLVSSVA		DVLAQGGGPR		SSQHCGEGSQ		LVAADHRGGL
DGWEQPGAGQ		PPSDT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Transient receptor potential cation channel subfamily M member 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14323 (англ.) . Архів оригіналу за 17 травня 2017. Процитовано 22 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-17 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q9NZQ8 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 11

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»