KCNIP3

KCNIP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2E6W
Ідентифікатори
Символи	KCNIP3, CSEN, DREAM, KCHIP3, potassium voltage-gated channel interacting protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604662 MGI: 1929258 HomoloGene: 8382 GeneCards: KCNIP3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • calcium ion binding • sequence-specific DNA binding • potassium channel activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • voltage-gated ion channel activity • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • potassium channel regulator activity • transmembrane transporter binding Клітинна компонента • цитоплазма • axon terminus • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • аксон • дендрит (нейробіологія) • protein-DNA complex • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • клітинна мембрана Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of ion transmembrane transport • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • ion transport • transcription, DNA-templated • potassium ion transport • potassium ion transmembrane transport • protein localization to plasma membrane • intracellular protein transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • cardiac conduction Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	30818	56461
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000079056
UniProt	Q9Y2W7	Q9QXT8 P0C092
RefSeq (мРНК)	NM_001034914 NM_013434	NM_001111331 NM_001291005 NM_019789
RefSeq (білок)	NP_001030086 NP_038462	NP_001104801 NP_001277934 NP_062763
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 2: 127.3 – 127.36 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KCNIP3 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 256 амінокислот, а молекулярна маса — 29 231[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQPAKEVTKA		SDGSLLGDLG		HTPLSKKEGI		KWQRPRLSRQ		ALMRCCLVKW
ILSSTAPQGS		DSSDSELELS		TVRHQPEGLD		QLQAQTKFTK		KELQSLYRGF
KNECPTGLVD		EDTFKLIYAQ		FFPQGDATTY		AHFLFNAFDA		DGNGAIHFED
FVVGLSILLR		GTVHEKLKWA		FNLYDINKDG		YITKEEMLAI		MKSIYDMMGR
HTYPILREDA		PAEHVERFFE		KMDRNQDGVV		TIEEFLEACQ		KDENIMSSMQ
LFENVI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, іонних каналів, потенціалзалежних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, апараті гольджі.

Література

• Carrion A.M., Link W.A., Ledo F., Mellstrom B., Naranjo J.R. (1999). DREAM is a Ca2+-regulated transcriptional repressor. Nature. 398: 80—84. PMID 10078534 DOI:10.1038/18044
• Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kunjilwar K., Strang C., DeRubeis D., Pfaffinger P.J. (2004). KChIP3 rescues the functional expression of Shal channel tetramerization mutants. J. Biol. Chem. 279: 54542—54551. PMID 15485870 DOI:10.1074/jbc.M409721200
• Jerng H.H., Kunjilwar K., Pfaffinger P.J. (2005). Multiprotein assembly of Kv4.2, KChIP3 and DPP10 produces ternary channel complexes with ISA-like properties. J. Physiol. (Lond.). 568: 767—788. PMID 16123112 DOI:10.1113/jphysiol.2005.087858
• Jerng H.H., Pfaffinger P.J. (2008). Multiple Kv channel-interacting proteins contain an N-terminal transmembrane domain that regulates Kv4 channel trafficking and gating. J. Biol. Chem. 283: 36046—36059. PMID 18957440 DOI:10.1074/jbc.M806852200

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15523 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
4. UniProt, Q9Y2W7 (англ.) . Архів оригіналу за 15 листопада 2016. Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»