KCNK1

KCNK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3UKM
Ідентифікатори
Символи	KCNK1, DPK, HOHO, K2P1, K2p1.1, KCNO1, TWIK-1, TWIK1, potassium two pore domain channel subfamily K member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601745 MGI: 109322 HomoloGene: 1691 GeneCards: KCNK1
Онтологія гена Молекулярна функція • sodium channel activity • potassium ion leak channel activity • voltage-gated potassium channel activity • inward rectifier potassium channel activity • potassium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • recycling endosome • перикаріон • ендосома • cell projection • мембрана • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • синапс • inward rectifier potassium channel complex • brush border membrane • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • potassium channel complex • apical plasma membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • sodium ion transmembrane transport • response to nicotine • ion transport • potassium ion transport • cardiac conduction • potassium ion transmembrane transport • regulation of resting membrane potential • stabilization of membrane potential Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3775	16525
Ensembl	ENSG00000135750	ENSMUSG00000033998
UniProt	O00180	O08581
RefSeq (мРНК)	NM_002245	NM_008430
RefSeq (білок)	NP_002236	NP_032456
Локус (UCSC)	Хр. 1: 233.61 – 233.67 Mb	Хр. 8: 126.72 – 126.76 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KCNK1 (англ. Potassium two pore domain channel subfamily K member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 336 амінокислот, а молекулярна маса — 38 143[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLQSLAGSSC		VRLVERHRSA		WCFGFLVLGY		LLYLVFGAVV		FSSVELPYED
LLRQELRKLK		RRFLEEHECL		SEQQLEQFLG		RVLEASNYGV		SVLSNASGNW
NWDFTSALFF		ASTVLSTTGY		GHTVPLSDGG		KAFCIIYSVI		GIPFTLLFLT
AVVQRITVHV		TRRPVLYFHI		RWGFSKQVVA		IVHAVLLGFV		TVSCFFFIPA
AVFSVLEDDW		NFLESFYFCF		ISLSTIGLGD		YVPGEGYNQK		FRELYKIGIT
CYLLLGLIAM		LVVLETFCEL		HELKKFRKMF		YVKKDKDEDQ		VHIIEHDQLS
FSSITDQAAG		MKEDQKQNEP		FVATQSSACV		DGPANH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах, ендосомах.

Література

• Goldstein S.A.N., Wang K.-W., Ilan N., Pausch M.H. (1998). Sequence and function of the two P domain potassium channels: implications of an emerging superfamily. J. Mol. Med. 76: 13—20. PMID 9462864 DOI:10.1007/s109-1998-8100-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rajan S., Plant L.D., Rabin M.L., Butler M.H., Goldstein S.A. (2005). Sumoylation silences the plasma membrane leak K+ channel K2P1. Cell. 121: 37—47. PMID 15820677 DOI:10.1016/j.cell.2005.01.019
• Ma L., Zhang X., Chen H. (2011). TWIK-1 two-pore domain potassium channels change ion selectivity and conduct inward leak sodium currents in hypokalemia. Sci. Signal. 4: RA37—RA37. PMID 21653227 DOI:10.1126/scisignal.2001726
• Zhao K.Q., Xiong G., Wilber M., Cohen N.A., Kreindler J.L. (2012). A role for two-pore K? channels in modulating Na? absorption and Cl? secretion in normal human bronchial epithelial cells. Am. J. Physiol. 302: L4—L12. PMID 21964404 DOI:10.1152/ajplung.00102.2011
• Plant L.D., Zuniga L., Araki D., Marks J.D., Goldstein S.A. (2012). SUMOylation silences heterodimeric TASK potassium channels containing K2P1 subunits in cerebellar granule neurons. Sci. Signal. 5: RA84—RA84. PMID 23169818 DOI:10.1126/scisignal.2003431

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6272 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.
4. UniProt, O00180 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»