TPCN1

TPCN1
Ідентифікатори
Символи	TPCN1, TPC1, two pore segment channel 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609666 MGI: 2182472 HomoloGene: 9905 GeneCards: TPCN1
Реагує на сполуку
phosphatidyl (3,5) inositol biphosphate, верапаміл[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium channel activity • voltage-gated ion channel activity • ion channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • NAADP-sensitive calcium-release channel activity • voltage-gated calcium channel activity • calcium activated cation channel activity Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • lysosomal membrane • лізосома • endosome membrane • CatSper complex Біологічний процес • membrane depolarization during action potential • positive regulation of autophagy • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • ion transmembrane transport • calcium ion transmembrane transport • calcium ion transport • трансмембранний транспорт • release of sequestered calcium ion into cytosol • flagellated sperm motility Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	53373	252972
Ensembl	ENSG00000186815	ENSMUSG00000032741
UniProt	Q9ULQ1	Q9EQJ0
RefSeq (мРНК)	NM_001143819 NM_001301214 NM_017901 NM_001351346 NM_001351347	NM_145853
RefSeq (білок)	NP_001137291 NP_001288143 NP_060371 NP_001338275 NP_001338276	NP_665852
Локус (UCSC)	Хр. 12: 113.22 – 113.3 Mb	Хр. 5: 120.67 – 120.73 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TPCN1 (англ. Two pore segment channel 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 816 амінокислот, а молекулярна маса — 94 147[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVSLDDDVP		LILTLDEGGS		APLAPSNGLG		QEELPSKNGG		SYAIHDSQAP
SLSSGGESSP		SSPAHNWEMN		YQEAAIYLQE		GENNDKFFTH		PKDAKALAAY
LFAHNHLFYL		MELATALLLL		LLSLCEAPAV		PALRLGIYVH		ATLELFALMV
VVFELCMKLR		WLGLHTFIRH		KRTMVKTSVL		VVQFVEAIVV		LVRQMSHVRV
TRALRCIFLV		DCRYCGGVRR		NLRQIFQSLP		PFMDILLLLL		FFMIIFAILG
FYLFSPNPSD		PYFSTLENSI		VSLFVLLTTA		NFPDVMMPSY		SRNPWSCVFF
IVYLSIELYF		IMNLLLAVVF		DTFNDIEKRK		FKSLLLHKRT		AIQHAYRLLI
SQRRPAGISY		RQFEGLMRFY		KPRMSARERY		LTFKALNQNN		TPLLSLKDFY
DIYEVAALKW		KAKKNREHWF		DELPRTALLI		FKGINILVKS		KAFQYFMYLV
VAVNGVWILV		ETFMLKGGNF		FSKHVPWSYL		VFLTIYGVEL		FLKVAGLGPV
EYLSSGWNLF		DFSVTVFAFL		GLLALALNME		PFYFIVVLRP		LQLLRLFKLK
ERYRNVLDTM		FELLPRMASL		GLTLLIFYYS		FAIVGMEFFC		GIVFPNCCNT
STVADAYRWR		NHTVGNRTVV		EEGYYYLNNF		DNILNSFVTL		FELTVVNNWY
IIMEGVTSQT		SHWSRLYFMT		FYIVTMVVMT		IIVAFILEAF		VFRMNYSRKN
QDSEVDGGIT		LEKEISKEEL		VAVLELYREA		RGASSDVTRL		LETLSQMERY
QQHSMVFLGR		RSRTKSDLSL		KMYQEEIQEW		YEEHAREQEQ		QRQLSSSAAP
AAQQPPGSRQ		RSQTVT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Two pore segment channel 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18182 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
5. UniProt, Q9ULQ1 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 12

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»