Профілін-1
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
1AWI , 1CF0 , 1CJF , 1FIK , 1FIL , 1PFL , 2PAV , 2PBD , 3CHW , 4X1L , 4X1M , 4X25
Ідентифікатори
Символи
PFN1 , ALS18, Profilin 1
Зовнішні ІД
OMIM : 176610 MGI: 97549 HomoloGene: 3684 GeneCards: PFN1
Пов'язані генетичні захворювання
amyotrophic lateral sclerosis type 18 [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• actin monomer binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • adenyl-nucleotide exchange factor activity • actin binding • proline-rich region binding • RNA binding • cadherin binding • signaling receptor binding • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding
Клітинна компонента
• гіалоплазма • blood microparticle • мембрана • focal adhesion • cell cortex • екзосома • цитоскелет • цитоплазма • клітинне ядро • міжклітинний простір • neuron projection • синапс • glutamatergic synapse
Біологічний процес
• positive regulation of actin filament polymerization • positive regulation of ATP-dependent activity • negative regulation of actin filament polymerization • positive regulation of ruffle assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • protein stabilization • positive regulation of epithelial cell migration • negative regulation of actin filament bundle assembly • neural tube closure • positive regulation of actin filament bundle assembly • negative regulation of stress fiber assembly • actin cytoskeleton organization • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • response to organic substance • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of viral transcription • positive regulation of DNA metabolic process • positive regulation of stress fiber assembly • cellular response to growth factor stimulus • regulation of actin filament polymerization • synapse maturation • modification of postsynaptic actin cytoskeleton
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 4.95 – 4.95 Mb
Хр. 11: 70.54 – 70.55 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
Профілін-1 (англ. Profilin 1 ) – білок, який кодується геном PFN1, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 140 амінокислот , а молекулярна маса — 15 054[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAGWNAYIDN LMADGTCQDA AIVGYKDSPS VWAAVPGKTF VNITPAEVGV
LVGKDRSSFY VNGLTLGGQK CSVIRDSLLQ DGEFSMDLRT KSTGGAPTFN
VTVTKTDKTL VLLMGKEGVH GGLINKKCYE MASHLRRSQY
Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину .
Локалізований у цитоплазмі , цитоскелеті .
Література
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Ampe C., Markey F., Lindberg U., Vandekerckhove J. (1988). The primary structure of human platelet profilin: reinvestigation of the calf spleen profilin sequence. FEBS Lett . 228 : 17—21. PMID 3342873 doi :10.1016/0014-5793(88)80575-1
Gieselmann R., Kwiatkowski D.J., Janmey P.A., Witke W. (1995). Distinct biochemical characteristics of the two human profilin isoforms. Eur. J. Biochem. 229 : 621—628. PMID 7758455 doi :10.1111/j.1432-1033.1995.tb20506.x
Stueven T., Hartmann E., Goerlich D. (2003). Exportin 6: a novel nuclear export receptor that is specific for profilin.actin complexes. EMBO J . 22 : 5928—5940. PMID 14592989 doi :10.1093/emboj/cdg565
Shao J., Welch W.J., Diprospero N.A., Diamond M.I. (2008). Phosphorylation of profilin by ROCK1 regulates polyglutamine aggregation . Mol. Cell. Biol . 28 : 5196—5208. PMID 18573880 doi :10.1128/MCB.00079-08
Mahoney N.M., Janmey P.A., Almo S.C. (1997). Structure of the profilin-poly-L-proline complex involved in morphogenesis and cytoskeletal regulation. Nat. Struct. Biol . 4 : 953—960. PMID 9360613 doi :10.1038/nsb1197-953
Примітки
Див. також