Кератин-10

Кератин-10
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4F1Z, 3ASW, 4ZRY
Ідентифікатори
Символи	KRT10, BCIE, BIE, CK10, EHK, K10, KPP, keratin 10
Зовнішні ІД	OMIM: 148080 MGI: 96685 GeneCards: KRT10
Пов'язані генетичні захворювання
epidermolytic hyperkeratosis, ichthyosis with confetti[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • structural molecule activity • structural constituent of skin epidermis • protein heterodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • екзосома • Проміжні філаменти • мембрана • клітинне ядро • міжклітинний простір • гіалоплазма • cornified envelope • extracellular region • cell surface Біологічний процес • keratinocyte differentiation • keratinization • cornification • GO:0051357, GO:0051358, GO:0051359 peptide cross-linking • positive regulation of epidermis development • protein heterotetramerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3858	16661
Ensembl	ENSG00000186395	ENSMUSG00000019761
UniProt	P13645	P02535
RefSeq (мРНК)	NM_000421 NM_001379366	NM_010660
RefSeq (білок)	NP_000412 NP_001366295	NP_034790
Локус (UCSC)	Хр. 17: 40.82 – 40.82 Mb	Хр. 11: 99.28 – 99.28 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Кератин-10 (англ. Keratin 10) – білок, який кодується геном KRT10, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 584 амінокислот, а молекулярна маса — 58 827[5]. Належить до великої родини кератинів — структурних білків цитоскелету.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVRYSSSKH		YSSSRSGGGG		GGGGCGGGGG		VSSLRISSSK		GSLGGGFSSG
GFSGGSFSRG		SSGGGCFGGS		SGGYGGLGGF		GGGSFRGSYG		SSSFGGSYGG
IFGGGSFGGG		SFGGGSFGGG		GFGGGGFGGG		FGGGFGGDGG		LLSGNEKVTM
QNLNDRLASY		LDKVRALEES		NYELEGKIKE		WYEKHGNSHQ		GEPRDYSKYY
KTIDDLKNQI		LNLTTDNANI		LLQIDNARLA		ADDFRLKYEN		EVALRQSVEA
DINGLRRVLD		ELTLTKADLE		MQIESLTEEL		AYLKKNHEEE		MKDLRNVSTG
DVNVEMNAAP		GVDLTQLLNN		MRSQYEQLAE		QNRKDAEAWF		NEKSKELTTE
IDNNIEQISS		YKSEITELRR		NVQALEIELQ		SQLALKQSLE		ASLAETEGRY
CVQLSQIQAQ		ISALEEQLQQ		IRAETECQNT		EYQQLLDIKI		RLENEIQTYR
SLLEGEGSSG		GGGRGGGSFG		GGYGGGSSGG		GSSGGGHGGG		HGGSSGGGYG
GGSSGGGSSG		GGYGGGSSSG		GHGGSSSGGY		GGGSSGGGGG		GYGGGSSGGG
SSSGGGYGGG		SSSGGHKSSS		SGSVGESSSK		GPRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Література

• Rieger M., Franke W.W. (1988). Identification of an orthologous mammalian cytokeratin gene. High degree of intron sequence conservation during evolution of human cytokeratin 10. J. Mol. Biol. 204: 841—856. PMID 2464696 DOI:10.1016/0022-2836(88)90045-9
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Darmon M.Y., Semat A., Darmon M.C., Vasseur M. (1987). Sequence of a cDNA encoding human keratin No 10 selected according to structural homologies of keratins and their tissue-specific expression. Mol. Biol. Rep. 12: 277—283. PMID 2448602 DOI:10.1007/BF00444680
• Rothnagel J.A., Longley M.A., Holder R.A., Kuster W., Roop D.R. (1994). Prenatal diagnosis of epidermolytic hyperkeratosis by direct gene sequencing. J. Invest. Dermatol. 102: 13—16. PMID 7507150 DOI:10.1111/1523-1747.ep12371723
• Tkachenko A.V., Buchman V.L., Bliskovsky V.V., Shvets Y.P., Kisselev L.L. (1992). Exons I and VII of the gene (Ker10) encoding human keratin 10 undergo structural rearrangements within repeats. Gene. 116: 245—251. PMID 1378806 DOI:10.1016/0378-1119(92)90521-P
• Korge B.P., Gan S.-Q., McBridge O.W., Mischke D., Steinert P.M. (1992). Extensive size polymorphism of the human keratin 10 chain resides in the C-terminal V2 subdomain due to variable numbers and sizes of glycine loops. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 910—914. PMID 1371013 DOI:10.1073/pnas.89.3.910

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з Кератин-10 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6413 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 30 січня 2017.
5. UniProt, P13645 (англ.) . Архів оригіналу за 30 грудня 2016. Процитовано 30 січня 2017.

Див. також

• Хромосома 17

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»