Berdasarkan data Kementerian Dalam Negeri tahun 2023, penduduk kecamatan Tondano Utara sangat beragam dalam agama yang dianut. Adapun persentasi penduduk Kecamatan Tondano Utara berdasarkan agama yang dianut ialah, yang memeluk agama Kristen sebanyak 73,98% dimana Protestan 71,32% dan Katolik 2,66%, kemudian sebagian lainnya beragama Islam yakni 26,02%. Sementara untuk rumah ibadah terdapat 4 masjid dan 50 Gereja.
