Berdasarkan data Kementerian Dalam Negeri tahun 2023, penduduk kecamatan Tondano Timur sangat beragam dalam agama yang dianut. Adapun persentasi penduduk Kecamatan Tondano Timur berdasarkan agama yang dianut ialah, yang memeluk agama Kristen sebanyak 98,73% dimana Protestan 96,75% dan Katolik 1,98%, kemudian sebagian lainnya beragama Islam yakni 1,27%. Sementara untuk rumah ibadah terdapat 22 Gereja.
Pembagian administratif
Kecamatan Tondano Timur terdiri dari 11 kelurahan, yaitu: