Sungai Jembayan merupakan sebuah sungai yang terletak di Kabupaten Kutai Kartanegara, Provinsi Kalimantan Timur, Indonesia. Sungai Jembayan memiliki panjang 180 kilometer mengalir dari arah baratdaya ke timurlaut. Sungai Jembayan berhulu di Perbukitan Gunung Patinjau diperbatasan Desa Jonggon Desa, Kecamatan Loa Kulu, Kabupaten Kutai Kartanegara dengan Kecamatan Sepaku, Kabupaten Penajam Paser Utara. Sungai Jembayan memiliki lebar sungai berkisar 20-80 meter dan kedalapan 2-6 meter sehingga dapat dilayari sepanjang 112 Km dari muara sungai.[1] Sungai Sungai Jembayan memiliki beberapa anak sungai diantaranya Sungai Beroak, Sungai Asam, Sungai Kedak, Sungai Jembayan Kanan, dan Sungai Gitan.