PTAFR

PTAFR
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2B0X
Ідентифікатори
Символи	PTAFR, PAFR, platelet activating factor receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 173393 MGI: 106066 HomoloGene: 20260 GeneCards: PTAFR
Реагує на сполуку
PAF[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • G protein-coupled receptor activity • G protein-coupled purinergic nucleotide receptor activity • lipopolysaccharide binding • signal transducer activity • mitogen-activated protein kinase binding • platelet activating factor receptor activity • phospholipid binding • lipopolysaccharide immune receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • secretory granule membrane • tertiary granule membrane Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of leukocyte tethering or rolling • inositol trisphosphate biosynthetic process • positive regulation of voltage-gated chloride channel activity • positive regulation of phospholipase C activity • negative regulation of blood pressure • interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of inositol phosphate biosynthetic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcytosis • GO:0032617 творба цитокінів • response to 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine • response to symbiotic bacterium • Цитопемпсис • positive regulation of translation • cellular response to gravity • response to dexamethasone • positive regulation of cellular extravasation • positive regulation of maternal process involved in parturition • хемотаксис • cellular response to 2-O-acetyl-1-O-hexadecyl-sn-glycero-3-phosphocholine • positive regulation of sensory perception of pain • response to lipopolysaccharide • cellular response to fatty acid • response to organophosphorus • народження • positive regulation of vasoconstriction • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of gastro-intestinal system smooth muscle contraction • positive regulation of tumor necrosis factor production • inflammatory response • positive regulation of smooth muscle contraction • positive regulation of neutrophil degranulation • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion • phosphatidylinositol-mediated signaling • lipopolysaccharide-mediated signaling pathway • cellular response to cAMP • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • G protein-coupled purinergic nucleotide receptor signaling pathway • neutrophil degranulation • cytokine-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5724	19204
Ensembl	ENSG00000169403	ENSMUSG00000056529
UniProt	P25105	Q62035
RefSeq (мРНК)	NM_001164723 NM_000952 NM_001164721 NM_001164722	NM_001081211
RefSeq (білок)	NP_000943 NP_001158193 NP_001158194 NP_001158195	NP_001074680
Локус (UCSC)	Хр. 1: 28.15 – 28.19 Mb	Хр. 4: 132.29 – 132.31 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTAFR (англ. Platelet activating factor receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот, а молекулярна маса — 39 203[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPHDSSHMD		SEFRYTLFPI		VYSIIFVLGV		IANGYVLWVF		ARLYPCKKFN
EIKIFMVNLT		MADMLFLITL		PLWIVYYQNQ		GNWILPKFLC		NVAGCLFFIN
TYCSVAFLGV		ITYNRFQAVT		RPIKTAQANT		RKRGISLSLV		IWVAIVGAAS
YFLILDSTNT		VPDSAGSGNV		TRCFEHYEKG		SVPVLIIHIF		IVFSFFLVFL
IILFCNLVII		RTLLMQPVQQ		QRNAEVKRRA		LWMVCTVLAV		FIICFVPHHV
VQLPWTLAEL		GFQDSKFHQA		INDAHQVTLC		LLSTNCVLDP		VIYCFLTKKF
RKHLTEKFYS		MRSSRKCSRA		TTDTVTEVVV		PFNQIPGNSL		KN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі як хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Ye R.D., Prossnitz E.R., Zou A., Cochrane C.G. (1991). Characterization of a human cDNA that encodes a functional receptor for platelet activating factor. Biochem. Biophys. Res. Commun. 180: 105—111. PMID 1656963 DOI:10.1016/S0006-291X(05)81261-6
• Seyfried C.E., Schweickart V.L., Godiska R., Gray P.W. (1992). The human platelet-activating factor receptor gene (PTAFR) contains no introns and maps to chromosome 1. Genomics. 13: 832—834. PMID 1322356 DOI:10.1016/0888-7543(92)90162-L
• Chase P.B., Halonen M., Regan J.W. (1993). Cloning of a human platelet-activating factor receptor gene: evidence for an intron in the 5'-untranslated region. Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. 8: 240—244. PMID 8383507 DOI:10.1165/ajrcmb/8.3.240
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kunz D., Gerard N.P., Gerard C. (1992). The human leukocyte platelet-activating factor receptor. cDNA cloning, cell surface expression, and construction of a novel epitope-bearing analog. J. Biol. Chem. 267: 9101—9106. PMID 1374385

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Platelet activating factor receptor переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9582 (англ.) . Архів оригіналу за 17 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-17 у Wayback Machine.]
5. UniProt, P25105 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»