CELSR1

CELSR1
Ідентифікатори
Символи	CELSR1, CDHF9, FMI2, HFMI2, ME2, ADGRC1, cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1, LMPHM9
Зовнішні ІД	OMIM: 604523 MGI: 1100883 HomoloGene: 7665 GeneCards: CELSR1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • G protein-coupled receptor activity • protein dimerization activity • signal transducer activity • transmembrane signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • нуклеоплазма Біологічний процес • hair follicle development • planar dichotomous subdivision of terminal units involved in lung branching morphogenesis • G protein-coupled receptor signaling pathway • lateral sprouting involved in lung morphogenesis • regulation of actin cytoskeleton organization • locomotory behavior • orthogonal dichotomous subdivision of terminal units involved in lung branching morphogenesis • establishment of planar polarity of embryonic epithelium • establishment of planar polarity • Загоєння ран • neuron migration • establishment of body hair planar orientation • planar cell polarity pathway involved in neural tube closure • multicellular organism development • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • central nervous system development • cell surface receptor signaling pathway • neural tube closure • адгезія клітин • inner ear morphogenesis • apical protein localization • Rho protein signal transduction • anterior/posterior pattern specification • GO:0072468 сигнальна трансдукція • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • protein localization involved in establishment of planar polarity • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9620	12614
Ensembl	ENSG00000075275	ENSMUSG00000016028
UniProt	Q9NYQ6	O35161
RefSeq (мРНК)	NM_014246 NM_001378328	NM_009886
RefSeq (білок)	NP_055061 NP_001365257	NP_034016
Локус (UCSC)	Хр. 22: 46.36 – 46.54 Mb	Хр. 15: 85.78 – 85.92 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CELSR1 (англ. Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 014 амінокислот, а молекулярна маса — 329 486[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPPPPPVLP		VLLLLAAAAA		LPAMGLRAAA		WEPRVPGGTR		AFALRPGCTY
AVGAACTPRA		PRELLDVGRD		GRLAGRRRVS		GAGRPLPLQV		RLVARSAPTA
LSRRLRARTH		LPGCGARARL		CGTGARLCGA		LCFPVPGGCA		AAQHSALAAP
TTLPACRCPP		RPRPRCPGRP		ICLPPGGSVR		LRLLCALRRA		AGAVRVGLAL
EAATAGTPSA		SPSPSPPLPP		NLPEARAGPA		RRARRGTSGR		GSLKFPMPNY
QVALFENEPA		GTLILQLHAH		YTIEGEEERV		SYYMEGLFDE		RSRGYFRIDS
ATGAVSTDSV		LDRETKETHV		LRVKAVDYST		PPRSATTYIT		VLVKDTNDHS
PVFEQSEYRE		RVRENLEVGY		EVLTIRASDR		DSPINANLRY		RVLGGAWDVF
QLNESSGVVS		TRAVLDREEA		AEYQLLVEAN		DQGRNPGPLS		ATATVYIEVE
DENDNYPQFS		EQNYVVQVPE		DVGLNTAVLR		VQATDRDQGQ		NAAIHYSILS
GNVAGQFYLH		SLSGILDVIN		PLDFEDVQKY		SLSIKAQDGG		RPPLINSSGV
VSVQVLDVND		NEPIFVSSPF		QATVLENVPL		GYPVVHIQAV		DADSGENARL
HYRLVDTAST		FLGGGSAGPK		NPAPTPDFPF		QIHNSSGWIT		VCAELDREEV
EHYSFGVEAV		DHGSPPMSSS		TSVSITVLDV		NDNDPVFTQP		TYELRLNEDA
AVGSSVLTLQ		ARDRDANSVI		TYQLTGGNTR		NRFALSSQRG		GGLITLALPL
DYKQEQQYVL		AVTASDGTRS		HTAHVLINVT		DANTHRPVFQ		SSHYTVSVSE
DRPVGTSIAT		LSANDEDTGE		NARITYVIQD		PVPQFRIDPD		SGTMYTMMEL
DYENQVAYTL		TIMAQDNGIP		QKSDTTTLEI		LILDANDNAP		QFLWDFYQGS
IFEDAPPSTS		ILQVSATDRD		SGPNGRLLYT		FQGGDDGDGD		FYIEPTSGVI
RTQRRLDREN		VAVYNLWALA		VDRGSPTPLS		ASVEIQVTIL		DINDNAPMFE
KDELELFVEE		NNPVGSVVAK		IRANDPDEGP		NAQIMYQIVE		GDMRHFFQLD
LLNGDLRAMV		ELDFEVRREY		VLVVQATSAP		LVSRATVHIL		LVDQNDNPPV
LPDFQILFNN		YVTNKSNSFP		TGVIGCIPAH		DPDVSDSLNY		TFVQGNELRL
LLLDPATGEL		QLSRDLDNNR		PLEALMEVSV		SDGIHSVTAF		CTLRVTIITD
DMLTNSITVR		LENMSQEKFL		SPLLALFVEG		VAAVLSTTKD		DVFVFNVQND
TDVSSNILNV		TFSALLPGGV		RGQFFPSEDL		QEQIYLNRTL		LTTISTQRVL
PFDDNICLRE		PCENYMKCVS		VLRFDSSAPF		LSSTTVLFRP		IHPINGLRCR
CPPGFTGDYC		ETEIDLCYSD		PCGANGRCRS		REGGYTCECF		EDFTGEHCEV
DARSGRCANG		VCKNGGTCVN		LLIGGFHCVC		PPGEYERPYC		EVTTRSFPPQ
SFVTFRGLRQ		RFHFTISLTF		ATQERNGLLL		YNGRFNEKHD		FIALEIVDEQ
VQLTFSAGET		TTTVAPKVPS		GVSDGRWHSV		QVQYYNKPNI		GHLGLPHGPS
GEKMAVVTVD		DCDTTMAVRF		GKDIGNYSCA		AQGTQTGSKK		SLDLTGPLLL
GGVPNLPEDF		PVHNRQFVGC		MRNLSVDGKN		VDMAGFIANN		GTREGCAARR
NFCDGRRCQN		GGTCVNRWNM		YLCECPLRFG		GKNCEQAMPH		PQLFSGESVV
SWSDLNIIIS		VPWYLGLMFR		TRKEDSVLME		ATSGGPTSFR		LQILNNYLQF
EVSHGPSDVE		SVMLSGLRVT		DGEWHHLLIE		LKNVKEDSEM		KHLVTMTLDY
GMDQNKADIG		GMLPGLTVRS		VVVGGASEDK		VSVRRGFRGC		MQGVRMGGTP
TNVATLNMNN		ALKVRVKDGC		DVDDPCTSSP		CPPNSRCHDA		WEDYSCVCDK
GYLGINCVDA		CHLNPCENMG		ACVRSPGSPQ		GYVCECGPSH		YGPYCENKLD
LPCPRGWWGN		PVCGPCHCAV		SKGFDPDCNK		TNGQCQCKEN		YYKLLAQDTC
LPCDCFPHGS		HSRTCDMATG		QCACKPGVIG		RQCNRCDNPF		AEVTTLGCEV
IYNGCPKAFE		AGIWWPQTKF		GQPAAVPCPK		GSVGNAVRHC		SGEKGWLPPE
LFNCTTISFV		DLRAMNEKLS		RNETQVDGAR		ALQLVRALRS		ATQHTGTLFG
NDVRTAYQLL		GHVLQHESWQ		QGFDLAATQD		ADFHEDVIHS		GSALLAPATR
AAWEQIQRSE		GGTAQLLRRL		EGYFSNVARN		VRRTYLRPFV		IVTANMILAV
DIFDKFNFTG		ARVPRFDTIH		EEFPRELESS		VSFPADFFRP		PEEKEGPLLR
PAGRRTTPQT		TRPGPGTERE		APISRRRRHP		DDAGQFAVAL		VIIYRTLGQL
LPERYDPDRR		SLRLPHRPII		NTPMVSTLVY		SEGAPLPRPL		ERPVLVEFAL
LEVEERTKPV		CVFWNHSLAV		GGTGGWSARG		CELLSRNRTH		VACQCSHTAS
FAVLMDISRR		ENGEVLPLKI		VTYAAVSLSL		AALLVAFVLL		SLVRMLRSNL
HSIHKHLAVA		LFLSQLVFVI		GINQTENPFL		CTVVAILLHY		IYMSTFAWTL
VESLHVYRML		TEVRNIDTGP		MRFYYVVGWG		IPAIVTGLAV		GLDPQGYGNP
DFCWLSLQDT		LIWSFAGPIG		AVIIINTVTS		VLSAKVSCQR		KHHYYGKKGI
VSLLRTAFLL		LLLISATWLL		GLLAVNRDAL		SFHYLFAIFS		GLQGPFVLLF
HCVLNQEVRK		HLKGVLGGRK		LHLEDSATTR		ATLLTRSLNC		NTTFGDGPDM
LRTDLGESTA		SLDSIVRDEG		IQKLGVSSGL		VRGSHGEPDA		SLMPRSCKDP
PGHDSDSDSE		LSLDEQSSSY		ASSHSSDSED		DGVGAEEKWD		PARGAVHSTP
KGDAVANHVP		AGWPDQSLAE		SDSEDPSGKP		RLKVETKVSV		ELHREEQGSH
RGEYPPDQES		GGAARLASSQ		PPEQRKGILK		NKVTYPPPLT		LTEQTLKGRL
REKLADCEQS		PTSSRTSSLG		SGGPDCAITV		KSPGREPGRD		HLNGVAMNVR
TGSAQADGSD		SEKP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Wu Q., Maniatis T. (2000). Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 3124—3129. PMID 10716726 DOI:10.1073/pnas.97.7.3124
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1850 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q9NYQ6 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 22

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»