OPN1SW

OPN1SW
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KPN
Ідентифікатори
Символи	OPN1SW, BCP, BOP, CBT, opsin 1 (cone pigments), short-wave-sensitive, opsin 1, short wave sensitive
Зовнішні ІД	OMIM: 613522 MGI: 99438 HomoloGene: 1291 GeneCards: OPN1SW
Пов'язані генетичні захворювання
тританопія[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • G protein-coupled receptor activity • photoreceptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled photoreceptor activity • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • photoreceptor outer segment • photoreceptor disc membrane Біологічний процес • відповідь на стимул • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • retinoid metabolic process • phototransduction • detection of visible light • G protein-coupled receptor signaling pathway • cellular response to light stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	611	12057
Ensembl	ENSG00000128617	ENSMUSG00000058831
UniProt	P03999	P51491
RefSeq (мРНК)	NM_001708 NM_001385125	NM_007538
RefSeq (білок)	NP_001699	NP_031564
Локус (UCSC)	Хр. 7: 128.77 – 128.78 Mb	Хр. 6: 29.38 – 29.39 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OPN1SW (англ. Opsin 1, short wave sensitive) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 348 амінокислот, а молекулярна маса — 39 135[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRKMSEEEFY		LFKNISSVGP		WDGPQYHIAP		VWAFYLQAAF		MGTVFLIGFP
LNAMVLVATL		RYKKLRQPLN		YILVNVSFGG		FLLCIFSVFP		VFVASCNGYF
VFGRHVCALE		GFLGTVAGLV		TGWSLAFLAF		ERYIVICKPF		GNFRFSSKHA
LTVVLATWTI		GIGVSIPPFF		GWSRFIPEGL		QCSCGPDWYT		VGTKYRSESY
TWFLFIFCFI		VPLSLICFSY		TQLLRALKAV		AAQQQESATT		QKAEREVSRM
VVVMVGSFCV		CYVPYAAFAM		YMVNNRNHGL		DLRLVTIPSF		FSKSACIYNP
IIYCFMNKQF		QACIMKMVCG		KAMTDESDTC		SSQKTEVSTV		SSTQVGPN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

• Nathans J., Thomas D., Hogness D.S. (1986). Molecular genetics of human color vision: the genes encoding blue, green, and red pigments. Science. 232: 193—202. PMID 2937147 DOI:10.1126/science.2937147
• Shimmin L.C., Mai P., Li W.H. (1997). Sequences and evolution of human and squirrel monkey blue opsin genes. J. Mol. Evol. 44: 378—382. PMID 9089077 DOI:10.1007/PL00006157
• Sarkar G., Sommer S.S. (1989). Access to a messenger RNA sequence or its protein product is not limited by tissue or species specificity. Science. 244: 331—334. PMID 2565599 DOI:10.1126/science.2565599
• Applebury M.L., Hargrave P.A. (1986). Molecular biology of the visual pigments. Vision Res. 26: 1881—1895. PMID 3303660 DOI:10.1016/0042-6989(86)90115-X
• Weitz C.J., Went L.N., Nathans J. (1992). Human tritanopia associated with a third amino acid substitution in the blue-sensitive visual pigment. Am. J. Hum. Genet. 51: 444—446. PMID 1386496

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з OPN1SW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1012 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-01 у Wayback Machine.]
5. UniProt, P03999 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 7

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»