GABBR2

GABBR2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4F11, 4F12, 4MQE, 4MQF, 4MR7, 4MR8, 4MR9, 4MRM, 4MS1, 4MS3, 4MS4, 4PAS
Ідентифікатори
Символи	GABBR2, GABABR2, GPR51, GPRC3B, HG20, HRIHFB2099, gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, EIEE59, NDPLHS, DEE59
Зовнішні ІД	OMIM: 607340 MGI: 2386030 HomoloGene: 55902 GeneCards: GABBR2
Пов'язані генетичні захворювання
посттравматичний стресовий розлад, early infantile epileptic encephalopathy 59[1]
Реагує на сполуку
arbaclofen placarbil, Гамма-оксимасляна кислота, arbaclofen, sgs-742[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled receptor activity • G protein-coupled GABA receptor activity • signal transducer activity • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • neuron projection • міжклітинні контакти • G protein-coupled receptor heterodimeric complex • клітинна мембрана • postsynaptic membrane • синапс • integral component of plasma membrane • мембрана • GABA receptor complex Біологічний процес • gamma-aminobutyric acid signaling pathway • G protein-coupled receptor signaling pathway • negative regulation of adenylate cyclase activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • chemical synaptic transmission • neuron-glial cell signaling Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9568	242425
Ensembl	ENSG00000136928	ENSMUSG00000039809
UniProt	O75899	Q80T41
RefSeq (мРНК)	NM_005458	NM_001081141
RefSeq (білок)	NP_005449	NP_001074610
Локус (UCSC)	Хр. 9: 98.29 – 98.71 Mb	Хр. 4: 46.66 – 46.99 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GABBR2 (англ. Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 941 амінокислот, а молекулярна маса — 105 821[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASPRSSGQP		GPPPPPPPPP		ARLLLLLLLP		LLLPLAPGAW		GWARGAPRPP
PSSPPLSIMG		LMPLTKEVAK		GSIGRGVLPA		VELAIEQIRN		ESLLRPYFLD
LRLYDTECDN		AKGLKAFYDA		IKYGPNHLMV		FGGVCPSVTS		IIAESLQGWN
LVQLSFAATT		PVLADKKKYP		YFFRTVPSDN		AVNPAILKLL		KHYQWKRVGT
LTQDVQRFSE		VRNDLTGVLY		GEDIEISDTE		SFSNDPCTSV		KKLKGNDVRI
ILGQFDQNMA		AKVFCCAYEE		NMYGSKYQWI		IPGWYEPSWW		EQVHTEANSS
RCLRKNLLAA		MEGYIGVDFE		PLSSKQIKTI		SGKTPQQYER		EYNNKRSGVG
PSKFHGYAYD		GIWVIAKTLQ		RAMETLHASS		RHQRIQDFNY		TDHTLGRIIL
NAMNETNFFG		VTGQVVFRNG		ERMGTIKFTQ		FQDSREVKVG		EYNAVADTLE
IINDTIRFQG		SEPPKDKTII		LEQLRKISLP		LYSILSALTI		LGMIMASAFL
FFNIKNRNQK		LIKMSSPYMN		NLIILGGMLS		YASIFLFGLD		GSFVSEKTFE
TLCTVRTWIL		TVGYTTAFGA		MFAKTWRVHA		IFKNVKMKKK		IIKDQKLLVI
VGGMLLIDLC		ILICWQAVDP		LRRTVEKYSM		EPDPAGRDIS		IRPLLEHCEN
THMTIWLGIV		YAYKGLLMLF		GCFLAWETRN		VSIPALNDSK		YIGMSVYNVG
IMCIIGAAVS		FLTRDQPNVQ		FCIVALVIIF		CSTITLCLVF		VPKLITLRTN
PDAATQNRRF		QFTQNQKKED		SKTSTSVTSV		NQASTSRLEG		LQSENHRLRM
KITELDKDLE		EVTMQLQDTP		EKTTYIKQNH		YQELNDILNL		GNFTESTDGG
KAILKNHLDQ		NPQLQWNTTE		PSRTCKDPIE		DINSPEHIQR		RLSLQLPILH
HAYLPSIGGV		DASCVSPCVS		PTASPRHRHV		PPSFRVMVSG		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Martin S.C., Russek S.J., Farb D.H. (1999). Molecular identification of the human GABABR2: cell surface expression and coupling to adenylyl cyclase in the absence of GABABR1. Mol. Cell. Neurosci. 13: 180—191. PMID 10328880 DOI:10.1006/mcne.1999.0741
• Clark J.A., Mezey E., Lam A.S., Bonner T.I. (2000). Distribution of the GABA(B) receptor subunit gb2 in rat CNS. Brain Res. 860: 41—52. PMID 10727622 DOI:10.1016/S0006-8993(00)01958-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nomura R., Suzuki Y., Kakizuka A., Jingami H. (2008). Direct detection of the interaction between recombinant soluble extracellular regions in the heterodimeric metabotropic gamma-aminobutyric acid receptor. J. Biol. Chem. 283: 4665—4673. PMID 18165688 DOI:10.1074/jbc.M705202200
• Geng Y., Bush M., Mosyak L., Wang F., Fan Q.R. (2013). Structural mechanism of ligand activation in human GABA(B) receptor. Nature. 504: 254—259. PMID 24305054 DOI:10.1038/nature12725

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з GABBR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4507 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-12 у Wayback Machine.]
6. UniProt, O75899 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 9

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»