Kota Pontianak dipimpin oleh PenjabatWali Kota Edi Suryanto, Ak., M.M. yang dilantik pada 4 November 2024 menggantikan Drs. Ani Sofian, M.M. yang juga penjabat wali kota.
Sebelumnya, wali kota Pontianak dijabat oleh Ir. H. Edi Rusdi Kamtono, M.M., M.T. bersama dengan Bahasan, S.H. sebagai wakil wali kota. Keduanya memenangkan 63,9% suara pada Pilwako 2018 dengan dukungan koalisi lima partai politik (Partai NasDem, Partai Golkar, Partai Gerindra, Partai Demokrat, dan PKPI), mengalahkan dua pasang kandidat lainnya. Sebelum dilantik pada 23 Desember 2018, Edi Rusdi Kamtono menjadi Plt. Wali Kota pada 5 September 2018 dan kemudian dilantik sebagai wali kota definitif pada 19 November 2018 untuk mengisi sisa masa jabatan 2013–2018.
Sebelumnya lagi, wali kota Pontianak dijabat oleh H. Sutarmidji, S.H., M.Hum. dengan Ir. H. Edi Rusdi Kamtono, M.M., M.T. sebagai wakilnya. Keduanya dilantik pada 23 Desember 2013 setelah, dengan dukungan lima partai politik (PDI-P, PKS, PPP, PAN, dan PKPB), memenangkan 52,7% suara pada Pemilukada 2013 lalu, mengalahkan lima pasangan kandidat lainnya.[1]
^Antara 14 Februari 2018 hingga 24 Juni 2018, tugas wali kota dijalankan oleh Dra. Mahmudah selaku Penjabat Sementara (Pjs.) dikarenakan Sutarmidji dan Edi Rusdi Kamtono wajib cuti untuk kampanye pilkada.
^Pelaksana Tugas (Plt.) menggantikan Sutarmidji yang dilantik menjadi gubernur Kalimantan Barat.
^Dilantik sebagai wali kota definitif pada 19 November 2018 untuk mengisi sisa masa jabatan.