Karena peranan aktifnya dalam ketidaksepakatan kultural dan keagamaan pada era Komunis, Halík ditunjuk Paus Yohanes Paulus II sebagai penasihat Dewan Kepausan untuk Dialog dengan Orang Tak Beragama pada tahun 1992.[2] Di Gereja St. Salvator di Praha, ia sering kali mengadakan doa dan meditasi bersama dengan umat beragama lainnya seperti Yahudi, Buddhis,[7] dan juga Muslim.[8] Karena pandangan-pandangannya tentang agama lain, dukungannya atas serikat sipil (tetapi bukan pernikahan sejenis) serta imigrasi, ia meraih pujian maupun kritik.[9][10]
^"Tomáš Halík se stane monsignorem" (dalam bahasa czech). iDnes.cz. 20 June 2008. Diakses tanggal 18 July 2016.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
^"Mezináboženský dialog na Foru 2000" (dalam bahasa czech). Katolický týdeník. 17 October 2006. Diakses tanggal 18 July 2016.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
^"INTERVIEW S TOMÁŠEM HALÍKEM" (dalam bahasa czech). SHEKEL.CZ. 23 August 2010. Diakses tanggal 18 July 2016.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)