Comastri lahir di Sorano dari pasangan Fernando dan Beneria (née Scossa) Comastri.[1] Ia meraih pendidikan awalnya di sekolah-sekolah di kota kelahirannya dan masuk seminari Pitigliano dan Seminari Regional S. Maria della Quercia di Viterbo.[1] Ia melanjutkan studinya di Universitas Kepausan Lateran di mana ia meraih Lisensi Teologi Keramat dan di Seminari Kepausan Roma.[1] Pada 11 Maret 1967, ia ditahbiskan menjadi imam oleh Uskup Luigi Boccadoro.[2]