GRIK2

GRIK2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3QXM, 5CMM
Ідентифікатори
Символи	GRIK2, EAA4, GLR6, GLUK6, GLUR6, GluK2, MRT6, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2, NEDLAS
Зовнішні ІД	OMIM: 138244 MGI: 95815 HomoloGene: 40717 GeneCards: GRIK2
Реагує на сполуку
selurampanel, топірамат[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • glutamate receptor activity • PDZ domain binding • kainate selective glutamate receptor activity • protein homodimerization activity • ion channel activity • ionotropic glutamate receptor activity • identical protein binding • ligand-gated ion channel activity • extracellularly glutamate-gated ion channel activity • signaling receptor activity • ubiquitin conjugating enzyme binding • ubiquitin protein ligase binding • ligand-gated ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential Клітинна компонента • integral component of membrane • перикаріон • postsynaptic membrane • мембрана • клітинна мембрана • синапс • integral component of plasma membrane • міжклітинні контакти • terminal bouton • аксон • дендрит (нейробіологія) • dendrite cytoplasm • ionotropic glutamate receptor complex • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • kainate selective glutamate receptor complex • presynaptic membrane • soma • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse • glutamatergic synapse Біологічний процес • neuron apoptotic process • glutamate receptor signaling pathway • modulation of chemical synaptic transmission • ion transport • receptor clustering • ion transmembrane transport • positive regulation of neuron apoptotic process • regulation of JNK cascade • ionotropic glutamate receptor signaling pathway • positive regulation of synaptic transmission • excitatory postsynaptic potential • negative regulation of synaptic transmission, glutamatergic • chemical synaptic transmission • behavioral fear response • cellular calcium ion homeostasis • intracellular protein transport • neuronal action potential • synaptic transmission, glutamatergic • regulation of membrane potential • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity • regulation of short-term neuronal synaptic plasticity • Гальмівний постсинаптичний потенціал • regulation of presynaptic membrane potential Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2898	14806
Ensembl	ENSG00000164418	ENSMUSG00000056073
UniProt	Q13002	P39087
RefSeq (мРНК)	NM_001166247 NM_021956 NM_175768	NM_001111268 NM_010349
RefSeq (білок)	NP_001159719 NP_068775 NP_786944	NP_001104738 NP_034479 NP_001345795
Локус (UCSC)	Хр. 6: 100.96 – 102.08 Mb	Хр. 10: 49.09 – 49.79 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GRIK2 (англ. Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 908 амінокислот, а молекулярна маса — 102 583[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKIIFPILSN		PVFRRTVKLL		LCLLWIGYSQ		GTTHVLRFGG		IFEYVESGPM
GAEELAFRFA		VNTINRNRTL		LPNTTLTYDT		QKINLYDSFE		ASKKACDQLS
LGVAAIFGPS		HSSSANAVQS		ICNALGVPHI		QTRWKHQVSD		NKDSFYVSLY
PDFSSLSRAI		LDLVQFFKWK		TVTVVYDDST		GLIRLQELIK		APSRYNLRLK
IRQLPADTKD		AKPLLKEMKR		GKEFHVIFDC		SHEMAAGILK		QALAMGMMTE
YYHYIFTTLD		LFALDVEPYR		YSGVNMTGFR		ILNTENTQVS		SIIEKWSMER
LQAPPKPDSG		LLDGFMTTDA		ALMYDAVHVV		SVAVQQFPQM		TVSSLQCNRH
KPWRFGTRFM		SLIKEAHWEG		LTGRITFNKT		NGLRTDFDLD		VISLKEEGLE
KIGTWDPASG		LNMTESQKGK		PANITDSLSN		RSLIVTTILE		EPYVLFKKSD
KPLYGNDRFE		GYCIDLLREL		STILGFTYEI		RLVEDGKYGA		QDDANGQWNG
MVRELIDHKA		DLAVAPLAIT		YVREKVIDFS		KPFMTLGISI		LYRKPNGTNP
GVFSFLNPLS		PDIWMYILLA		YLGVSCVLFV		IARFSPYEWY		NPHPCNPDSD
VVENNFTLLN		SFWFGVGALM		QQGSELMPKA		LSTRIVGGIW		WFFTLIIISS
YTANLAAFLT		VERMESPIDS		ADDLAKQTKI		EYGAVEDGAT		MTFFKKSKIS
TYDKMWAFMS		SRRQSVLVKS		NEEGIQRVLT		SDYAFLMEST		TIEFVTQRNC
NLTQIGGLID		SKGYGVGTPM		GSPYRDKITI		AILQLQEEGK		LHMMKEKWWR
GNGCPEEESK		EASALGVQNI		GGIFIVLAAG		LVLSVFVAVG		EFLYKSKKNA
QLEKRSFCSA		MVEELRMSLK		CQRRLKHKPQ		APVIVKTEEV		INMHTFNDRR
LPGKETMA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Paschen W., Blackstone C.D., Huganir R.L., Ross C.A. (1994). Human GluR6 kainate receptor (GRIK2): molecular cloning, expression, polymorphism, and chromosomal assignment. Genomics. 20: 435—440. PMID 8034316 DOI:10.1006/geno.1994.1198
• Barbon A., Vallini I., Barlati S. (2001). Genomic organization of the human GRIK2 gene and characterization of multiple splicing variants. Gene. 274: 187—197. PMID 11675011 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00611-4
• Wilkinson K.A., Konopacki F., Henley J.M. (2012). Modification and movement: Phosphorylation and SUMOylation regulate endocytosis of GluK2-containing kainate receptors. Commun. Integr. Biol. 5: 223—226. PMID 22808340 DOI:10.4161/cib.19195
• Paschen W., Hedreen J.C., Ross C.A. (1994). RNA editing of the glutamate receptor subunits GluR2 and GluR6 in human brain tissue. J. Neurochem. 63: 1596—1602. PMID 7523595
• Nutt S.L., Kamboj R.K. (1994). RNA editing of human kainate receptor subunits. NeuroReport. 5: 2625—2629. PMID 7696618

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4580 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2017. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2017-12-29 у Wayback Machine.]
5. UniProt, Q13002 (англ.) . Архів оригіналу за 2 січня 2018. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»