GLRB

GLRB
Ідентифікатори
Символи	GLRB, HKPX2, glycine receptor beta
Зовнішні ІД	OMIM: 138492 MGI: 95751 HomoloGene: 20224 GeneCards: GLRB
Пов'язані генетичні захворювання
hyperekplexia 2[1]
Реагує на сполуку
bilobalide, ніфедипін, pregnenolone sulfate, picrotoxin[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • glycine binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • extracellularly glycine-gated ion channel activity • chloride channel activity • extracellular ligand-gated ion channel activity • extracellularly glycine-gated chloride channel activity • ion channel activity • transmembrane signaling receptor activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • postsynaptic membrane • cell projection • мембрана • синапс • chloride channel complex • glycine-gated chloride channel complex • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • integral component of plasma membrane • клітинна мембрана • GABA-ergic synapse • glycinergic synapse • neuron projection Біологічний процес • response to amino acid • переляк • protein heterooligomerization • regulation of membrane potential • gamma-aminobutyric acid receptor clustering • chloride transmembrane transport • нейробіологія розвитку • акросомна реакція • neuromuscular process • righting reflex • chloride transport • neuropeptide signaling pathway • зір • adult walking behavior • ion transport • synaptic transmission, glycinergic • excitatory postsynaptic potential • chemical synaptic transmission • ion transmembrane transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • nervous system process • regulation of postsynaptic membrane potential Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2743	14658
Ensembl	ENSG00000109738	ENSMUSG00000028020
UniProt	P48167	P48168
RefSeq (мРНК)	NM_000824 NM_001166060 NM_001166061	NM_001281969 NM_010298 NM_001345955 NM_001345956 NM_001345957 NM_001345958 NM_001345959 NM_001345996
RefSeq (білок)	NP_000815 NP_001159532 NP_001159533	NP_001268898 NP_001332884 NP_001332885 NP_001332886 NP_001332887 NP_001332888 NP_001332925 NP_034428
Локус (UCSC)	Хр. 4: 157.08 – 157.17 Mb	Хр. 3: 80.75 – 80.82 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GLRB (англ. Glycine receptor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 497 амінокислот, а молекулярна маса — 56 122[6].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKFLLTTAFL		ILISLWVEEA		YSKEKSSKKG		KGKKKQYLCP		SQQSAEDLAR
VPANSTSNIL		NRLLVSYDPR		IRPNFKGIPV		DVVVNIFINS		FGSIQETTMD
YRVNIFLRQK		WNDPRLKLPS		DFRGSDALTV		DPTMYKCLWK		PDLFFANEKS
ANFHDVTQEN		ILLFIFRDGD		VLVSMRLSIT		LSCPLDLTLF		PMDTQRCKMQ
LESFGYTTDD		LRFIWQSGDP		VQLEKIALPQ		FDIKKEDIEY		GNCTKYYKGT
GYYTCVEVIF		TLRRQVGFYM		MGVYAPTLLI		VVLSWLSFWI		NPDASAARVP
LGIFSVLSLA		SECTTLAAEL		PKVSYVKALD		VWLIACLLFG		FASLVEYAVV
QVMLNNPKRV		EAEKARIAKA		EQADGKGGNV		AKKNTVNGTG		TPVHISTLQV
GETRCKKVCT		SKSDLRSNDF		SIVGSLPRDF		ELSNYDCYGK		PIEVNNGLGK
SQAKNNKKPP		PAKPVIPTAA		KRIDLYARAL		FPFCFLFFNV		IYWSIYL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, іонних каналів, хлорних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Miller P.S., Harvey R.J., Smart T.G. (2004). Differential agonist sensitivity of glycine receptor alpha2 subunit splice variants. Br. J. Pharmacol. 143: 19—26. PMID 15302677 DOI:10.1038/sj.bjp.0705875
• Miller P.S., Da Silva H.M., Smart T.G. (2005). Molecular basis for zinc potentiation at strychnine-sensitive glycine receptors. J. Biol. Chem. 280: 37877—37884. PMID 16144831 DOI:10.1074/jbc.M508303200
• Yang Z., Taran E., Webb T.I., Lynch J.W. (2012). Stoichiometry and subunit arrangement of alpha1beta glycine receptors as determined by atomic force microscopy. Biochemistry. 51: 5229—5231. PMID 22715885 DOI:10.1021/bi300063m
• Zhang Y., Dixon C.L., Keramidas A., Lynch J.W. (2015). Functional reconstitution of glycinergic synapses incorporating defined glycine receptor subunit combinations. Neuropharmacology. 89: 391—397. PMID 25445488 DOI:10.1016/j.neuropharm.2014.10.026

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з GLRB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Glycine receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4329 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
6. UniProt, P48167 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2018. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 4

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»