Der ersten Nachweise einer Besiedlung finden sich aus der Jungsteinzeit. Verschiedene indoeuropäische Stämme mischten sich mit den Eingeboren Stämmen.
Die ersten Urkundlichen Erwähnungen sind mit dem Einmarsch der römischen Legionen datiert. Die Gegend um Onis war hier eine wichtige Enklave während der Kriege zwischen Rom und den Kantabrischen Stämmen.
1504 wurde der erste Alcalde eingesetzt. Unter der Regentschaft von Juan González de Acebos fiel 1594 Onis dem Fürstentum Asturien zu.
Wirtschaft
Die gesamte Region wird geprägt durch Land und Forstwirtschaft; in Onis ist speziell die Produktion des (in Spanien) berühmten Käses aus Gamonedo zu erwähnen