Berdasarkan data Kementerian Dalam Negeri tahun 2023, penduduk kecamatan Mapanget sangat beragam dalam agama yang dianut. Adapun persentasi penduduk Kecamatan Mapanget berdasarkan agama yang dianut ialah, yang memeluk agama Kristen sebanyak 77,04% dimana Protestan 68,85% dan Katolik 8,19%, kemudian sebagian lainnya beragama Islam yakni 22,28%. Pemeluk agama Buddha sebanyak 0,44% adapun Hindu 0,23% dan lainnya 0,02% .Sementara untuk rumah ibadah 26 masjid , 113 gereja dan 1 vihara.
