巴賽語音系 （英語：Basay phonology ）為巴賽語 之音系 。而其音系之音位 大都使用適當的Unicode 符號來標示。在台灣南島語 的書寫系統 的訂定上，元輔音之音系表原則上都是先「發音部位 」(橫列)、後「發音方法 」(縱列)、再考量「清濁音 」，來訂定其音系之音位架構。[ 1]
自1990年代之後李壬癸 院士的研究提出該語與噶瑪蘭語 (Kbalan)似乎較為雷同。與噶瑪蘭語在詞彙，音韻，構詞，句法，語音等方面不但對應也極相近。[ 2]
除大台北地區，基隆市，新北市金山區、萬里區、瑞芳區、貢寮區等外，宜蘭縣 "社頭"(trobiawan,哆囉美遠)族群亦歸屬為巴賽語群。[ 3] [ 4] [ 1] [ 5]
使用17個拉丁字母 ，一個二合字母 /ng[ŋ]/，全部18字母。字母分為元音 及輔音 二大部分。元音4個（i、u、e/ə /oe、a），輔音14個（p、b→{v}、t、c、k→{q}、m、n、ng、s、z、l、r、w、y）、另加上2個輔音語音轉換字母（{v}、{q}）。因/ng/沒有用在單詞的開頭故無大寫。聲門塞音/ʔ[']/，或用撇號 /'/符號、或則省略。[ 6] 字母 (d,f,g,h,j,o,q,v,x)用在增音、特殊表示，及外來語 上。[ 7]
byq大寫字母
A
B
C
E
I
K
L
M
N
P
R
S
T
U
W
Y
Z
' (ʔ)
byq小寫字母
a
b
c
e
i
k
l
m
n
ng p
r
s
t
u
w
y
z
' (ʔ)
巴賽語基本上有4個元音 字母，14個輔音 字母，1個聲門塞音 符號。[ 6] 輔音 分清 濁 ，不分送氣 與不送氣 ；有輕重音 之语气 表現，但無類似闽南语 的聲調 。[ 8] 貢寮區 babang（新社/B）及宜蘭縣 trobiawan（哆囉美遠/T、社頭）二地區語音上有/b/→/{v}/及/k/→/{q}/之音變 轉換。[ 6] 台灣南島語 的書寫系統 的訂定，原則上都是先「發音部位 」（橫列）、後「發音方法 」（縱列）、再考量「清濁音 」，來訂定其書寫字母。[ 9] 輔音 /d/,/g/,/h/,/x/，及半閉元音 /e/與/o/均作增音時使用。須注意中央元音 /ə/用/e/表示，須與半閉前不圓唇元音 /e/有所區別。/auw/或/au/可用/aw/替代，/ai/可用/ay/替代，/eu/與/eo/可用/iw/替代，/oi/可用/uy/替代。[ 6]
從音變過程不但可以觀察出語種之間的連繫關係，亦可以看出語種在時間流程上之演化進程。巴賽語及噶瑪蘭語 之語音關係、在音素 方面，除了*p, *b, *m, *N, *w, *y, *i, *u 基本保持不變外，兩者亦有五種共同的音變 。且其中兩種音變只存於巴賽語與噶瑪蘭語：(1).*j, *n 與 *N 的合併、(2).*k 的分裂為k 與q，屬於這兩種語言的共同創新音變。且巴賽語也保存了古南島語的一些語音如/bukəS>bukəs/(頭髮)等。[ 4] [ 2] [ 10]
以下列出巴賽語、噶瑪蘭語，及原始南島語 （PAN/古南島語）等之語音 對應關係。[ 11] [ 10] [ 12]
1). 語音對應關係(1)：
IPA p t k q β z ʁ ɬ ɮ s ɾ s
巴賽語 p t k h b z r/l l /l/ c r s
噶瑪蘭語 p t k q b z x/R l/d l/d s r/l s
PAN *p *t/C* *k *k *b *Z *R *d *l *s *r *S
2). 語音對應關係(2)：
IPA
m n ŋ w y i u ə/u/i a
巴賽語
m n ng w y i u e/u/i a
噶瑪蘭語
m n ng w y i u e/i a
PAN
*m *n *ng *w *y *i *u *e *a
於1936年10月台北帝國大學 人类学 教授 淺井惠倫 對新北市 三貂社 (Santiago/Ki vanow-an)新社巴賽語發音人「潘氏腰 」(時年75歲)進行語音記錄之研究。[ 13] [ 14] [ 15]
Sa-tzay-an na spaw ki vanow-an (三貂社祭祖歌)
原文 ：Naqai, ilainata punaririn imu, baki, bai kakazaui.中文 ：來！祖父，祖母，咱獻酒供食予你們。拉丁 ：Naqa-i! ilainata puna-ri-rin-imu, baki, bai ka-kazaui.
原文：Qamenimau punu-wanak-ake nuvayp-aku, palalamau cilakcaki.
^ 1.0 1.1 李壬癸,"宜蘭縣南島民族與語言",宜蘭縣政府,1996年10月. ISBN 957-00-8252-6 （巴賽文）
^ 2.0 2.1 李壬癸院士,"珍惜台灣南島語言",前衛出版社,2010-1,p.201.ISBN 9789578016354 （巴賽文）
^ 陳志榮 著,"噶瑪蘭人的宗教變遷"存档副本 . [2010-04-04 ] . （原始内容 存档于2010-06-12）.
^ 4.0 4.1 李壬癸/中央研究院,"巴賽語的地位"[1] [永久失效連結 （巴賽文）
^ SIL International,"Ethnologue report for language code: byq"[2] （页面存档备份 ，存于互联网档案馆 ）,Ethnologue-Languages of the World,2011.
^ 6.0 6.1 6.2 6.3 李壬癸(1999), “Some Problems in the Basay Language”,台灣南島語言論文選集(第1冊),中央研究院語言學研究所,台北,2004/11,p.481. ISBN 957-01-8413-2 GPN 1009303036 （英文）
^ 李壬癸(Paul Jen-kuei Li),"臺灣南島語言的語音符號(Orthographic Systems for Formosan Languages)",教育部教育研究委員會(Ministry of Education ROC),臺北市(Taipei),中華民國八十年五月(May 1991).
^ 國立自然科學博物館(2001)，人口與分佈，見南島語族 [online]。台中：國立自然科學博物館。[引用於2005年1月19日]。全球資訊網網址：存档副本 . [2004-12-06 ] . （原始内容 存档于2004-12-06）.
^ 行政院原住民族委員會,"原住民族語言書寫系統"存档副本 (PDF) . [2017-06-01 ] . （原始内容 (PDF) 存档于2011-02-12）.
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^ 李壬癸,"台灣北部平埔族種類及其互動關係"存档副本 . [2013-03-02 ] . （原始内容 存档于2013-06-17）.
^ Paul Jen-kuei Li ,"Origins of the East Formosans: Basay, Kavalan, Amis, and Siraya"存档副本 (PDF) . [2014-02-02 ] . （原始内容 (PDF) 存档于2009-03-27）.
^ 拍攝者:宮本延人,"貢寮新社平埔老嫗潘氏腰"[3] ,人類學:臺灣原住民族:平埔族群:凱達格蘭(Ketagalan):影像-數位典藏與學習聯合目錄,攝製地點:台北州基隆郡貢寮庄新社/社名:三貂新社/行政隸屬:台北縣貢寮鄉雙玉村,攝製時間:昭和11年（1936）10月.
^ 噶瑪蘭與凱達格蘭/藏品資料/靜態影像,"(新北市)貢寮新社平鋪老嫗潘氏腰(照片)"[4] （页面存档备份 ，存于互联网档案馆 ）,國科會國家型科技計畫─臺灣大學數位典藏創新應用前鋒計畫(EPEE)/1930年代臺灣平埔族群影音資料整合應用與推廣放映計畫,2011.
^ 陳淑華,"噶瑪蘭族",秋雨文化事業公司,2006年10月. ISBN 978-986-00-6775-0
本土信徒總檔,"訪記「北投社」凱達格蘭人潘慧耀長老"[5] （页面存档备份 ，存于互联网档案馆 ）,賴永祥長老史料庫,2011年.
莊華堂,"巴賽風雲",唐山出版社,2007/09/01.ISBN 9789867021540
Jack Ryalls, Susan J. Behrens,"Introduction to Speech Science--From basic theories to clinical application(言語科學概論--從基礎理論到臨床應用)"[6] （页面存档备份 ，存于互联网档案馆 ）,World Publishing; 1 edition (April 24, 2003),pp.167. ISBN 978-0205291007