LCK
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: E9PI33 PDBe E9PI33 RCSB
Список кодів PDB
1BHF , 1BHH , 1CWD , 1CWE , 1FBZ , 1H92 , 1IJR , 1KIK , 1LCJ , 1LCK , 1LKK , 1LKL , 1Q68 , 1Q69 , 1QPC , 1QPD , 1QPE , 1QPJ , 1X27 , 2IIM , 2OF2 , 2OF4 , 2OFU , 2OFV , 2OG8 , 2PL0 , 2ZM1 , 2ZM4 , 2ZYB , 3AC1 , 3AC2 , 3AC3 , 3AC4 , 3AC5 , 3AC8 , 3ACJ , 3ACK , 3AD4 , 3AD5 , 3AD6 , 3B2W , 3BRH , 3BYM , 3BYO , 3BYS , 3BYU , 3KMM , 3KXZ , 3LCK , 3MPM , 4D8K , 4C3F
Ідентифікатори
Символи
LCK , LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase, IMD22, LSK, YT16, p56lck, pp58lck
Зовнішні ІД
OMIM : 153390 MGI: 96756 HomoloGene: 3911 GeneCards: LCK
Пов'язані генетичні захворювання
severe combined immunodeficiency due to LCK deficiency [ 1]
Реагує на сполуку
saracatinib , SU6656 [ 2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 32.25 – 32.29 Mb
Хр. 4: 129.44 – 129.47 Mb
PubMed search
[ 3]
[ 4] Вікідані
LCK (англ. LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[ 5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот , а молекулярна маса — 58 001[ 6] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGCGCSSHPE DDWMENIDVC ENCHYPIVPL DGKGTLLIRN GSEVRDPLVT
YEGSNPPASP LQDNLVIALH SYEPSHDGDL GFEKGEQLRI LEQSGEWWKA
QSLTTGQEGF IPFNFVAKAN SLEPEPWFFK NLSRKDAERQ LLAPGNTHGS
FLIRESESTA GSFSLSVRDF DQNQGEVVKH YKIRNLDNGG FYISPRITFP
GLHELVRHYT NASDGLCTRL SRPCQTQKPQ KPWWEDEWEV PRETLKLVER
LGAGQFGEVW MGYYNGHTKV AVKSLKQGSM SPDAFLAEAN LMKQLQHQRL
VRLYAVVTQE PIYIITEYME NGSLVDFLKT PSGIKLTINK LLDMAAQIAE
GMAFIEERNY IHRDLRAANI LVSDTLSCKI ADFGLARLIE DNEYTAREGA
KFPIKWTAPE AINYGTFTIK SDVWSFGILL TEIVTHGRIP YPGMTNPEVI
QNLERGYRMV RPDNCPEELY QLMRLCWKER PEDRPTFDYL RSVLEDFFTA
TEGQYQPQP
Кодований геном білок за функціями належить до тирозинових протеїнкіназ родини Src-протеїнкіназ .
Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус .
Білок має сайт для зв'язування з АТФ .
Локалізований у клітинній мембрані , цитоплазмі .
Література
Wright D.D., Sefton B.M., Kamps M.P. (1994). Oncogenic activation of the Lck protein accompanies translocation of the LCK gene in the human HSB2 T-cell leukemia . Mol. Cell. Biol . 14 : 2429—2437. PMID 8139546 DOI :10.1128/MCB.14.4.2429
Vogel L.B., Arthur R., Fujita D.J. (1995). An aberrant lck mRNA in two human T-cell lines. Biochim. Biophys. Acta . 1264 : 168—172. PMID 7495859 DOI :10.1016/0167-4781(95)00162-A
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Garvin A.M., Pawar S., Marth J.D., Perlmutter R.M. (1988). Structure of the murine lck gene and its rearrangement in a murine lymphoma cell line . Mol. Cell. Biol . 8 : 3058—3064. PMID 2850479 DOI :10.1128/MCB.8.8.3058
Vogel L.B., Fujita D.J. (1993). The SH3 domain of p56lck is involved in binding to phosphatidylinositol 3'-kinase from T lymphocytes . Mol. Cell. Biol . 13 : 7408—7417. PMID 7504174 DOI :10.1128/MCB.13.12.7408
Vogel L.B., Fujita D.J. (1995). p70 phosphorylation and binding to p56lck is an early event in interleukin-2-induced onset of cell cycle progression in T-lymphocytes. J. Biol. Chem . 270 : 2506—2511. PMID 7852312 DOI :10.1074/jbc.270.6.2506
Примітки
Див. також