У листопаді 1934 року його звільнено «за націоналістичні прояви в лекціях» та «перекручування програми». 25 листопада 1935 року заарештовано у Києві. Постановою Особливої наради при НКВС від 3 липня 1936 року заслано на 5 років у концтабір у Воркуті[2].
Григорій Костюк був звільнений 25 листопада1940 року, та згідно з приписом НКВС оселився у Слов'янську. Влітку 1941 року одружився з Раїсою Бутко.
Від грудня 1940 року до липня 1944 року жив і працював (здебільшого не за фахом) у Слов'янську, Києві, Львові. У липні 1944 року емігрував на Захід.
Григорій Костюк був реабілітований 22 червня1989 року.
23 жовтня1992 року в Боришківцях відбувся вечір, присвячений 90-річчю Костюка. На вечорі виступив його син — Теодор Костюк — доктор фізико-астрономічних наук.
4 червня2008 року видавництво «Смолоскип» провело в Києві презентацію двотомника спогадів Григорія Костюка «Зустрічі і прощання», вперше перевиданого в Україні.
Восени 2006 року головну вулицю села Боришківці названо іменем Григорія Костюка.
Бібліографія
Твори Григорія Костюка
Григорій Костюк — автор наукових праць «Панас Мирний. Життя і творчість» (1931), «The Fall of Postyshew» (1954), «Stalinist Rule in the Ukraine» (1960), «Володимир Винниченко і його доба» (1980), «У світі ідей та образів» (1983); книг «З літопису літературного життя в діаспорі» (1971), спогадів «Окаянні роки» (1978) та «Зустрічі й прощання» (Т. 1. — 1987, Т. 2. — 1998). Підготував до видання два томи «Щоденника» В.Винниченка, п'ятитомне видання творів М.Хвильового (1978—1986), твори М. Куліша (1955), П. Филиповича, М. Драй-Хмари та ін.
Українське наукове літературознавство в перше пореволюційне п'ятнадцятиліття // Записки НТШ. — Т. 173. — Париж — Чикаго, 1962. — С. 185—216.
Григорій Костюк: «І впадуть єрихонські стіни» / Вів розмову Юрій Пригорницький // Літературна Україна. — 1991. — 30 травня. — С. 6.
Кошелівець Іван. Ентузіаст відродження. Неювілейне про Григорія Костюка // Дзвін. — 1991. — № 12. — С. 125—130.
Козак Сергій. До срібного джерела // Літературна Україна. — 1995. — 21 вересня. — С. 8.
Мацько В. Озвались струнами гаї: Ювілеї // Кам'янець-Подільський вісник. — 1992. — 7 листопада. — С. 3.
Сохацька Є. І. І. Огієнко і Г. О. Костюк // Культура Поділля: історія і сучасність. — Хмельницький, 1993. — С. 233—236.
Мацько В. Озвались струнами гаї // Мацько В. Злотонить. — Кам'янець-Подільський, 1994. — С. 74—80.
Мацько Віталій. До України пригорнусь… [Текст]: (До 95-річчя Григорія Костюка) / Віталій Мацько // Дивослово. — 1997. — N10 — С. 59—61.
Листи Григорія Костюка до Віталія Мацька // Слово і час. — 2002. — № 10. — С. 10—12.
Третяк Л. Їх поєднав Кам'янець // Збірник наукових праць Кам'янець-Подільського державного педагогічного університету. — Серія філологічна. — Випуск 2. — Кам'янець-Подільський, 1998. — С. 235—238.
Літературна Хмельниччина XX століття: Хрестоматія. — Хмельницький, 2005. — С. 86—93.
Письменники української діаспори: Донбаський вимір / [упоряд. В. А. Просалова]. — Донецьк : Східний видавничий дім, 2010. — 336 с.
Подоляк Б. Шлях творчих випробувань і перемог // Слово. Збірник 2. — Нью-Йорк, 1964. — С. 212—220.
Біляїв В. Зустрічі й прощання Григорія Костюка // Нові дні. — 1989. — № 6. — С. 29-39.
Боднарчук І. Спогади Григорія Костюка // Нові дні. — 1989. — № 2 — С. 21-22.
Гарасевич М. Володимир Винниченко та його доба // Ми не розлучались з тобою, Україно: Вибране. — Детройт, 1998. — С. 209—219.
Голубенко П. На полі бою (Життєвий шлях Г.Костюка) // Нові дні. — 1982. — № 12. — С. 15-18.
Жила В. І тривоги, і радощі…: До 90-річчя життя і літ. діяльності Григорія Костюка // Визвольний шлях. — 1998. — № 4. — С. 491—496.
Жулинський М. Зустрічі без прощань на українському просторі XX століття // Зустрічі і прощання: Спогади. — К.: Смолоскип, 2008. — Кн. 1. — С. 5-20.
Нитченко Д. Григорієві Костюкові сімдесят років // Нові дні. — 1993. — № 3. — С. 14-15.
Нитченко Д. Григорій Костюк // Новий обрій. Альманах. — Мельборн, 1999. — Ч. 11. — С. 276—278.
Пригорницький Ю. Григорій Костюк: «І впадуть Єрихонські стіни» // Літ. Україна. — 1991. — 30 травня.
Ротач П. Мемуарна епопея // Слово і час. — 1991. — № 7.
Світайло Л. Р. Костюк Григорій Олександрович // Українська літературна енциклопедія: У 5 т. — К.: Українська енциклопедія ім. М. П. Бажана, 1995. — Т. 3. — С. 22.
Творча спадщина Григорія Костюка в контексті сучасної наукової думки: матеріали Всеукраїнської наукової конференції. — К. — Хмельницький, 2002. — 154 с.
Будзей Олег. Три літературні ювілеї одного дня. Боришковецький «шмаркач» // Подолянин. — 2012. — 19 жовтня. — С. 8.