Marty Deeks, l'officier de liaison avec la police de Los Angeles, est porté disparu alors qu'il était en mission d'infiltration auprès de trafiquants internationaux, dont un des leaders, Ortega, vient de mourir dans un attentat à la bombe. Le NCIS doit retrouver Deeks avant le mafieux serbe, Lazik, qui vient d'atterrir à Los Angeles pour régler ses comptes...
Walter Fauntleroy (Edward Mintoya, caporal des marines)
Zachary Stockdale (Liam Walker, première classe des marines)
Ashanti Brown (Shelly Hastings, caporal des marines)
Dusty Sorg (Jerry J)
Résumé détaillé
Quand une vidéo montrant des Marines se faisant attaquer en Arizona est diffusée, l'équipe du NCIS est chargée de trouver les auteurs et de sauver les Marines.
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Pendant la recherche des assaillants dans le désert, on en apprend un peu plus sur la vie de Kensi. L'agent Deeks, quant à lui, éprouve des difficultés à s'adapter loin de Los Angeles.
Le directeur du NCIS, Leon Vance est mentionnée par Hetty dans cet épisode.
Épisode 4 : Tu ne voleras point
Titre original
Special Delivery (trad. litt. : « Livraison spéciale »)
Sam passe au-delà de la juridiction du NCIS quand la fille d'un commandant spécialiste de la sécurité est enlevée, ce qui déclenche chez lui de nombreux flashbacks...
Matthew Grant Godbey (Dan Evans, agent de coordination du LAPD)
Leyna Nguyen (Reporter ZNN)
Résumé détaillé
Tracy Keller, ancienne partenaire de Callen, prend en otage un bureau de recrutement de la Marine afin de retrouver Callen et de solliciter son aide pour démasquer le cerveau derrière le détournement de missiles antichars israéliens.
Un employé du département d'État et un chirurgien plasticien sont assassinés. L'équipe découvre que tous les membres d'une cellule terroriste très active ont fait modifier leur apparence. Ils doivent trouver la seule personne qui puisse les identifier avant qu'ils ne passent à l'offensive.
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Leon Vance, le directeur du NCIS, est mentionné dans cet épisode.
Quand un ancien sergent, responsable de la traque des plus importantes cibles, est trouvé mort, l’équipe du NCIS se lance à la recherche des leaders terroristes suspectés de son assassinat. En parallèle, Deeks se lie étroitement avec un suspect de l’affaire, le rendant plus déterminé que jamais à attraper les meurtriers.
À Hollywood, le meurtre d’un antiquaire suisse, aussi connu des services de police pour des ventes d’armes illicites, réveille les craintes d’anciens espions internationaux dont l’identité sera compromise à la découverte du carnet d’adresses que tenait la victime. Hetty apparaît sur cette liste noire que son équipe tente de trouver par tous les moyens...
Hetty est à la recherche du meurtrier de Cole et du livre tant convoité dont la possession est devenue un enjeu sanglant. Callen se rend au logement de Cole et découvre que le tueur avait désactivé le système de surveillance vidéo. Cependant, il parvient à récupérer quelques images qui lui apportent la preuve que des Russes sont mêlés à l'affaire. Mattias révèle à Hetty que sa libération a été acceptée en échange du livre. Kensi se fait capturer par les Russes, car ils sont persuadés que celle-ci détient le livre puis l'agent du NCIS comprend alors qu'une course contre la montre débute : il faut retrouver le document avant que les Russes ou que Mattias ne mettent la main dessus et ne disparaissent...
Alors que tout le monde s'apprête à fêter Noël, des coups de feu éclatent dans un quartier résidentiel de Los Angeles. La police découvre deux cadavres dans une maison et fait appel au NCIS quand il s'avère que le seul survivant est un ancien officier du renseignement naval, Brent Talbot. Il semble souffrir d'un syndrome post-traumatique et s'avère incapable de raconter ce qui s'est passé dans la maison. Kensi, dont l'ancien petit ami était aussi atteint du même mal, sympathise avec Brent. Elle le ramène chez lui, pensant que retourner sur les lieux du crime l'aidera à retrouver la mémoire...
Peter Cambor (Nate Getz, psychologue opérationnel)
Résumé détaillé
Le corps d'un programmeur est enlevé, sous les yeux du médecin légiste Rose Schwartz, alors qu'elle venait de découvrir sur lui un marqueur biologique d'un projet top secret de la Navy.
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Petite apparition du personnage de Nate Getz, en photo dans le labo de Rose.
À la suite de l'activation de l'alerte « Archange » par le Pentagone, l'équipe se charge de l'enquête sur un vol présumé de données pouvant porter atteinte à la sécurité nationale.
En prison, Mowahd est victime d'une agression. Sam se fait donc incarcérer sous couverture pour infiltrer un groupe terroriste basé au Yémen en se rapprochant de son chef, un autre détenu.
Alors qu'il rentre chez lui, Callen surprend un intrus à son domicile et l'arrête. En l'interrogeant, il découvre que l'inconnu, qui se prénomme Niko, a tout comme lui travaillé pour un ancien membre du KGB, Arkady. Callen reprend contact avec ce dernier qui lui apprend que Rameesh Nayam-Singh, un philantrophe indien, attend la livraison d'une cargaison de puces informatiques contrefaites. Alors que Callen semble se désintéresser de cette information, Arkady lui montre une photo qui pourrait permettre à l'agent d'en savoir plus sur son passé. Pour pénétrer l'entourage de Rameesh Nayam-Singh, Kensi se fait passer pour une voyante capable de lire les lignes de la main...
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Dans des séquences de flash-backs, Finley O'Donnell, le fils de Chris O'Donnell (G. Callen), interprète le petit Callen âgé de 5 ans.
Épisode 16 : Protéger, servir et empocher / Infiltrés
Ted Wallof (Smith, motard de la police de Los Angeles)
Jeronimo Spinx (Thompson, agent du NCIS)
Résumé détaillé
Sam et Callen sont chargés d'infiltrer une brigade de policiers à moto soupçonnés de se livrer à divers trafics, avec la complicités de plusieurs marines du camp de Pendleton. L'officier Paul Beane, qui fait partie de la brigade, a été tué pour avoir refusé une mission de livraison illégale. Sa partenaire, Jennifer Grear, profite allègrement des bénéfices du trafic. Alors qu'ils se font toujours passer pour des motards de la police californienne, Sam et Callen découvrent que l'échange auquel Paul Beane a refusé de participer concerne, non pas de la drogue et du matériel militaire, mais une ogive nucléaire volée...
Marty Deeks surprend des cambrioleurs en pleine action dans son café habituel après son jogging matinal. Il est attaqué et blessé. Il semble bien qu'il s'agisse d'une embuscade et que ceux qui ont mis au point ce plan machiavélique avaient l'intention d'éliminer leur cible, sans lui laisser aucune chance de s'en sortir. Grâce à ses amis, qui sont intervenus rapidement, Deeks n'a été que blessé. À l'hôpital, il bénéficie de la protection de Kensi. De leur côté, Callen et Sam examinent la scène de crime afin de recueillir des indices. Ils remontent la piste des tireurs, au moment même où ceux-ci s'apprêtent à frapper de nouveau, à l'hôpital cette fois. Dans la fusillade qui s'ensuit, le chauffeur des meurtriers est abattu, mais le reste de la bande parvient à s'enfuir...
Le NCIS doit protéger la vie d'un homme politique vénézuélien, vraisemblablement mis en danger après la disparition d'un commandant des services secrets de la Marine, chargé de le surveiller.
Une installation sécurisée sur une base maritime est cambriolée. L'un des malfaiteurs réussit à s'échapper. Kensi doit s'infiltrer dans le milieu de ce voleur de classe mondiale, pour connaître ce qu'il cherchait à voler.
Après l'assassinat d'un expert en moteur-fusée, Eric Beale, le technicien informatique, part en infiltration pour la première fois afin de s'assurer que la technologie secrète utilisée n'est pas tombée entre de mauvaises mains.
Le meilleur ami et principal informateur de Marty Deeks est le témoin clé contre le leader d'un groupe de trafiquants d'armes. Malgré son changement d'identité, ce groupe arrive à le retrouver et tente de le tuer. Pour le protéger, Deeks doit reprendre une identité qu'il n'a pas reprise depuis longtemps.
Un homme se faisant passer pour un ancien Marine a été transformé en torche humaine, ce qui met l’équipe sur la trace d’une précédente affaire concernant un vol de matériel radioactif. L’homme était lié à un groupe radical antigouvernemental susceptible de vouloir fabriquer une bombe sale avec le matériel dérobé. Au cours de l’enquête, l’équipe apprend avec surprise la démission de Hetty…
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Suite de l'épisode 12 Overwatch.
Le directeur du NCIS, Leon Vance est mentionné dans cet épisode.
Hetty n'est plus à la tête du NCIS. Remplacée à la hâte par Lauren Hunter, sans en avertir l'équipe, elle a disparu dans la nature. Mais Callen n'entend pas en rester là et demande à sa direction de partir à sa recherche. Le directeur Vance et Hunter s'y opposent, obligeant toute l'équipe à démissionner pour venir en aide à Hetty. Selon les premiers indices débusqués, elle se trouverait à Constanța en Roumanie...