Pimpinan Pusat Ikatan Sarjana Nahdlatul Wathan (PIMPUS IS.NW) dalam mewujudkan program kerjanya berinisiatif mendirikan Lembaga Pendidikan Tinggi dalam bentuk Universitas dan diberi nama Universitas Nahdlatul Wathan (UNW) Mataram pada tahun 1987;
Dalam proses selanjutnya untuk menyesuaikan dengan ketentuan yang berlaku, maka Pimpinan Pusat Ikatan Sarjana Nahdlatul Wathan menyerahkan pengurusan/pengelolaan lembaga pendidikan tinggi tersebut diserahkan kepada Pengurus Yayasan Pendidikan (Pondok Pesantren) Darul Mujahidin NW Mataram. Pada tahap awalnya Universitas Nahdlatul Wathan (UNW) Mataram menawarkan 4 (empat) fakultas, yaitu:
Fakultas Pertanian, jurusan Teknologi Pertanian dan Budidaya Pertanian
Fakultas Ilmu Administrasi, jurusan Administrasi Negara dan Administrasi Niaga
Fakultas Sastra, jurusan Sastra Indonesia, Sastra Inggris dan Sastra Asia Barat / Sastra Arab
Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Jurusan Matematika dan Biologi
Keempat Fakultas dan Jurusan tersebut memperoleh ijin pertama dengan status Terdaftar berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan RI. Dengan Surat nomor: 0389/O/1991 tertanggal 22 Juni 1991 dan diperpanjang ijin penyelenggaraannya pada tahun 2005, 2006.
Dalam rangka memenuhi kebutuhan masyarakat / pembangunan Nusa Tenggara Barat secara berangsur-angsur Pengurus Yayasan Penyelenggara UNW Mataram menambah / membuka fakultas baru sebagai berikut:
Tahun 1996 Fakultas Peternakan, dengan Program studi Produksi Ternak dan Nutrisi Makanan Ternak yang memperoleh Status Terdaftar berdasarkan Keputusan MENDIKBUD RI Nomor: 442/Dikti/Kep/1996, Tanggal 22 Agustus 1996.
Tahun 2003 mengajukan permohonan ijin ke Direktur Jenderal Kelembagaan Agama Islam Departemen Agama, dan diijinkan untuk membuka Fakultas Agama Islam dengan Jurusan Tarbiyah / Program Studi Pendidikan Agama Islam Jurusan Syari’ah / Program Studi Ahwal Al-Syakhshiyah Jurusan Ushuluddin / Program Studi Tafsir Hadits dengan surat ijin nomor: Dj.II/533/2003 tanggal 20 Nopember 2003 atas rekomendasi Kopertais Wilayah IV Surabaya Nomor: 414/PP.03.2 KOP.IV/2003 tanggal 16 Juli 2003.
Tahun 2004 mengajukan Ijin Penyelenggaraan Fakultas Hukum (FH) dan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP), karena yang dianggap sangat mendesak dan diperlukan untuk memenuhi kebutuhan guru di SMP/MTs., SMA/MA, maka Universitas Nahdlatul Wathan Mataram mendapatkan Ijin dari Ditjen Dikti untuk Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP) dengan Program Studi Pendidikan Ekonomi dengan Surat Ijin penyelenggaraan Nomor: 3801/D/T/2004 tanggal 21 September 2004, disamping itu untuk menampung calon mahasiswa yang ingin studi lanjut ke-bidang Kesehatan sesuai kebutuhan daerah, maka pihak yayasan penyelenggara Universitas Nahdlathul Wathan (UNW) Mataram membuka Program Diploma Tiga (D.III) Keperawatan. yang memperoleh Ijin Penyelenggaraan dari Dirjen Dikti pada tanggal 9 Agustus 2004 dengan suratnya nomor: 3053/D/T/2004, setelah terlebih dahulu mendapatkan rekomendasi dari Kepala BPSM. Kesehatan nomor: Hk.03.2.4.1.0.2053, tanggal 16 Juni 2004.
Pada tanggal 12 April 2004 Rektor Universitas Nahdlatul Wathan (UNW) Mataram mengajukan Ijin PenyelenggaraanProgram Diploma Dua (D.2) PGMI dan PGRA. memperoleh Ijin dari Koordinator KOPERTIS Wilayah IV Surabaya pada tanggal 17 April 2004 dengan surat nomor: 987/SK/KOP.IV/2004 sedangkan Program Akta IV non Tarbiyah /Kependidikan Koordinator KOPERTAIS Wilalayah IV Surabaya memberikan Ijin pada tanggal 28 Juli 2004, surat nomor: 4022.b/SK/KOP.IV/2004.
Pada tanggal 19 Mei 2005 Ijin penyelenggaraan Program Studi Ilmu Hukum dari Dirjen Dikti Depdiknas RI dikeluarkan dengan nomor: 1664/D/T/2005.
Untuk melengkapi bidang ilmu kesehatan yang ada, Pengurus yayasan mengajukan ijin penyelenggaraan Program Diploma Tiga (D.3) Kebidanan ke-Ditjen Dikti dan sebelumnya mengajukan permohonan rekomendasi kepada Kepala Badan Pengembangan dan Pemberdayaan Sumberdaya Manusia Kesehatan Departemen Kesehatan RI. Program Studi Kebidanan dengan jenjang Diploma Tiga (D.III) memperoleh Ijin dari Dirjen Dikti pada tanggal 29 Desember 2005 dengan surat nomor: 4155/D/T/2005.
Pada tanggal 24 Juni 2006 Pengurus Yayasan mengajukan permohonan ijin untuk membuka Program Studi Pendidikan Bahasa Inggris, yang mendapat tanggapan dari Ditjen Dikti berupa pertimbangan dengan suratnya nomor: 2127/D2.2/2006 tertanggal 10 Oktober 2006, serta ijin penyelenggaraan dengan surat nomor: 4888/D/T/2006, tanggal 21 Desember 2006;
Pada tanggal 15 Agustus 2006 Pengurus Yayasan mengajukan permohonan ijin untuk membuka Program Studi Pendidikan Matematika, yang mendapat tanggapan dari Ditjen Dikti berupa pertimbangan dengan suratnya nomor: 0112/D2.2/2006 tertanggal 12 Januar1 2007, serta ijin penyelenggaraan dengan surat nomor:2096/D/T/2006, tanggal 2 Agustus 2007;
Pada tanggal 28 Februari 2007 Pengurus Yayasan menga- jukan permohonan ijin untuk membuka Program Studi Farmasi (D.III), yang mendapat tanggapan dari Ditjen Dikti berupa pertimbangan dengan surat nomor: 0888/D2.2/2007 tertanggal 19 April 2007, serta ijin penyelenggaraan dengan surat nomor: 1581/D/T/2007, tanggal 29 Juni 2007 setelah mendapatkan rekomendasi dari Kepala Badan Pengembangan dan Pemberdayaan Sumberdaya Manusia Kesehatan Departemen Kesehatan RI Jakarta; nomor:HK.03.2.41.01578, tanggal 28 Maret 2007. Dan memiliki rangking nasional ke-456 menurut UniRank.[1]