Saudara Ahmed I (1603–17), Mustafa I dilaporkan menderita retardasi mental atau setidaknya mengidap penyakit saraf. Semasa pemerintahan saudaranya, ia dikurung di ruangan penjara selama 14 tahun.
Sejak ia memerintah, tampak jelas bagaimana tangan-tangan asing memainkan peran dalam penentuan, penetapan dan pemecatan para khalifah
Pada 1618 ia diturunkan dari tahta dan digantikan oleh Osman II (1618–22), tetapi setelah pembunuhan Osman II pada 1622 ia naik tahta kembali dan menjabatnya hingga dijatuhkan dan dipenjara oleh saudara Osman II, Murad IV (1623–40). Mustafa I meninggal 16 tahun kemudian.