Indonesia telah memenuhi syarat total sepuluh pemain bulutangkis untuk setiap event berikut ke dalam turnamen Olimpiade berdasarkan Peringkat Dunia BWF per 5 Mei 2016: dua pasang di ganda campuran, masing-masing pasangan ganda putra dan putri, dan satu Masuk masing-masing di tunggal putra dan putri.
Indonesia telah menerima undangan dari UCI untuk mengirim pembalap BMX pria ke Olimpiade, sebagai negara dengan peringkat teratas yang memenuhi syarat, yang belum belum terkualifikasi, dalam Daftar Peringkat Olimpiade UCI 31 Mei 2016, yang menandakan kembalinya Olimpiade ke negara tersebut Olahraga untuk pertama kalinya sejak tahun 2004. Pebalap peringkat teratas BMX Indonesia dan finalis posisi keempat Asian Games 2014 Toni Syarifudin didaftarkan di Olimpiade pada tanggal 8 Juni 2016.[8]