Kecamatan Gunungsitoli Idanoi dibagi menjadi 26 desa, yakni;[2]
Awa'ai
Bawodesolo
Binaka
Dahana
Fadoro
Fowa
Helefanikha
Hilihambawa
Hilimbawodesolo
Hilimbowo Idanoi
Hiliweto Idanoi
Humene
Idanotae
Lewuoguru Idanoi
Lolo'ana'a Idanoi
Ombolata
Onowaembo
Samasi
Sifalaete
Simanaere
Siwalubanua I
Siwalubanua II
Tetehosi I
Tetehosi II
Tuhegeo I
Tuhegeo II
Demografi
Pada tahun 2020, penduduk kecamatan Gunungsitoli Idanoi berjumlah 22.485 jiwa dengan kepadatan 167,00 jiwa/km2. Sebagian besar penduduk kota Gunungsitoli, dan juga di kecamatan Gunungsitoli Idanoi berasal dari suku Nias, yang merupakan suku asli setempat. Kemudian ada pula pendatang lainnya seperti suku Batak, Jawa, Minangkabau, Pesisir, dan suku lainnya.
Sementara agama yang dianut, berdasarkan data Badan Pusat Statistik kota Gunungsitoli 2021, penduduk kecamatan Gunungsitoli Idanoi mayoritas menganut agama Kristen yakni 91,16%, dimana Protestan 81,21% dan Katolik 9,95% yang umumnya berasal dari suku Nias dan Batak. Sebagian lagi beragama Islam yakni 8,84%, umumnya berasal dari suku Jawa dan Minangkabau.[3]