Прото-онкоген RET

прото-онкоген RET
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IVS, 2IVT, 2IVU, 2IVV, 2X2K, 2X2L, 2X2M, 2X2U, 4CKI, 4CKJ, 4UX8, 5AMN
Ідентифікатори
Символи	RET, Ret, PTC, RET51, RET9, c-Ret, CDHF12, CDHR16, HSCR1, MEN2A, MEN2B, MTC1, RET-ELE1, ret proto-oncogene
Зовнішні ІД	OMIM: 164761 MGI: 97902 HomoloGene: 7517 GeneCards: RET
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак, familial medullary thyroid carcinoma, Множинна ендокринна неоплазія тип 2Б, феохромоцитома, множинна ендокринна неоплазія тип 2А, hereditary pheochromocytoma-paraganglioma, adrenal gland pheochromocytoma, Медулярний рак щитоподібної залози[1]
Реагує на сполуку
linifanib, ponatinib, сорафеніб, сунітиніб, vandetanib[2]
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • calcium ion binding • protein kinase activity • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • signaling receptor activity • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • receptor tyrosine kinase • transmembrane signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • ендосома • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • receptor complex • integral component of plasma membrane • аксон • soma • дендрит (нейробіологія) • early endosome • membrane raft • endosome membrane • клітинна мембрана • гіалоплазма • plasma membrane protein complex • цитоплазма Біологічний процес • cellular response to retinoic acid • ureteric bud development • embryonic epithelial tube formation • membrane protein proteolysis • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • positive regulation of cell migration • neuron cell-cell adhesion • нейробіологія розвитку • neuron maturation • positive regulation of metanephric glomerulus development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of axonogenesis • protein phosphorylation • enteric nervous system development • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • regulation of cell adhesion • lymphocyte migration into lymphoid organs • адгезія клітин • GO:1901313 positive regulation of gene expression • ureter maturation • response to pain • retina development in camera-type eye • neural crest cell migration • neuron differentiation • positive regulation of cell size • positive regulation of neuron projection development • posterior midgut development • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • іннервація • positive regulation of neuron maturation • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • Peyer's patch morphogenesis • peptidyl-tyrosine phosphorylation • MAPK cascade • axon guidance • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation of STAT protein • glial cell-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of signal transduction • диференціація клітин • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • Нейрогенез Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5979	19713
Ensembl	ENSG00000165731	ENSMUSG00000030110
UniProt	P07949	P35546
RefSeq (мРНК)	NM_000323 NM_020629 NM_020630 NM_020975 NM_001355216	NM_001080780 NM_009050
RefSeq (білок)	NP_065681 NP_066124 NP_001342145 NP_066124.1	NP_001074249 NP_033076
Локус (UCSC)	Хр. 10: 43.08 – 43.13 Mb	Хр. 6: 118.13 – 118.17 Mb
PubMed search	[3]	[4]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Прото-онкоген RET (англ. Ret proto-oncogene) – білок, який кодується геном RET, розташованим у людини на довгому плечі 10-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 114 амінокислот, а молекулярна маса — 124 319[6]. Цей білок належить до рецепторних тирозинкіназ, членів GDNF-родини лігандів (англ. glial cell line-derived neurotrophic factor family). RET знаходиться в позаклітинному просторі, девпливає на регуляцію сигнальних шляхів ERK, PI3K.[7]

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAKATSGAAG		LRLLLLLLLP		LLGKVALGLY		FSRDAYWEKL		YVDQAAGTPL
LYVHALRDAP		EEVPSFRLGQ		HLYGTYRTRL		HENNWICIQE		DTGLLYLNRS
LDHSSWEKLS		VRNRGFPLLT		VYLKVFLSPT		SLREGECQWP		GCARVYFSFF
NTSFPACSSL		KPRELCFPET		RPSFRIRENR		PPGTFHQFRL		LPVQFLCPNI
SVAYRLLEGE		GLPFRCAPDS		LEVSTRWALD		REQREKYELV		AVCTVHAGAR
EEVVMVPFPV		TVYDEDDSAP		TFPAGVDTAS		AVVEFKRKED		TVVATLRVFD
ADVVPASGEL		VRRYTSTLLP		GDTWAQQTFR		VEHWPNETSV		QANGSFVRAT
VHDYRLVLNR		NLSISENRTM		QLAVLVNDSD		FQGPGAGVLL		LHFNVSVLPV
SLHLPSTYSL		SVSRRARRFA		QIGKVCVENC		QAFSGINVQY		KLHSSGANCS
TLGVVTSAED		TSGILFVNDT		KALRRPKCAE		LHYMVVATDQ		QTSRQAQAQL
LVTVEGSYVA		EEAGCPLSCA		VSKRRLECEE		CGGLGSPTGR		CEWRQGDGKG
ITRNFSTCSP		STKTCPDGHC		DVVETQDINI		CPQDCLRGSI		VGGHEPGEPR
GIKAGYGTCN		CFPEEEKCFC		EPEDIQDPLC		DELCRTVIAA		AVLFSFIVSV
LLSAFCIHCY		HKFAHKPPIS		SAEMTFRRPA		QAFPVSYSSS		GARRPSLDSM
ENQVSVDAFK		ILEDPKWEFP		RKNLVLGKTL		GEGEFGKVVK		ATAFHLKGRA
GYTTVAVKML		KENASPSELR		DLLSEFNVLK		QVNHPHVIKL		YGACSQDGPL
LLIVEYAKYG		SLRGFLRESR		KVGPGYLGSG		GSRNSSSLDH		PDERALTMGD
LISFAWQISQ		GMQYLAEMKL		VHRDLAARNI		LVAEGRKMKI		SDFGLSRDVY
EEDSYVKRSQ		GRIPVKWMAI		ESLFDHIYTT		QSDVWSFGVL		LWEIVTLGGN
PYPGIPPERL		FNLLKTGHRM		ERPDNCSEEM		YRLMLQCWKQ		EPDKRPVFAD
ISKDLEKMMV		KRRDYLDLAA		STPSDSLIYD		DGLSEEETPL		VDCNNAPLPR
ALPSTWIENK		LYGMSDPNWP		GESPVPLTRA		DGTNTGFPRY		PNDSVYANWM
LSPSAAKLMD		TFDS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Ген

Ген RET розташований на короткому плечі 10-ї хромосоми на позиції 11.2 (10q11.2), складається з 21 екзону. Різноманітні аномалії (транслокації (перестановки), мутації), що можуть виникати в RET, часто спостерігаються при медулярній та папілярній карциномах щитоподібної залози, феохромоцитомі та гіперплазії паращитоподібних залоз[8].

Роль RET під час розвитку організму

Трансдукція сигналів RET відіграє важливу роль в нормальному розвитку нирки та ентеральної нервової системи[9], частини периферійної нервової системи, яка регулює діяльність гладенької мускулатури.

Див. також

• Хромосома 10

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Takahashi M., Cooper G.M. (1987). ret transforming gene encodes a fusion protein homologous to tyrosine kinases. Mol. Cell. Biol. 7: 1378—1385. PMID 3037315 DOI:10.1128/MCB.7.4.1378
• Corvi R., Berger N., Balczon R., Romeo G. (2000). RET/PCM-1: a novel fusion gene in papillary thyroid carcinoma. Oncogene. 19: 4236—4242. PMID 10980597 DOI:10.1038/sj.onc.1203772
• Klugbauer S., Rabes H.M. (1999). The transcription coactivator HTIF1 and a related protein are fused to the RET receptor tyrosine kinase in childhood papillary thyroid carcinomas. Oncogene. 18: 4388—4393. PMID 10439047 DOI:10.1038/sj.onc.1202824
• Graham Robinett R., Freemerman A.J., Skinner M.A., Shewchuk L., Lackey K. (2007). The discovery of substituted 4-(3-hydroxyanilino)-quinolines as potent RET kinase inhibitors. Bioorg. Med. Chem. Lett. 17: 5886—5893. PMID 17884497 DOI:10.1016/j.bmcl.2007.07.104
• Tsui C.C., Pierchala B.A. (2008). CD2AP and Cbl-3/Cbl-c constitute a critical checkpoint in the regulation of ret signal transduction. J. Neurosci. 28: 8789—8800. PMID 18753381 DOI:10.1523/JNEUROSCI.2738-08.2008

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з прото-онкоген RET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Прото-онкоген RET переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
3. Human PubMed Reference:.
4. Mouse PubMed Reference:.
5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9967 (англ.) . Архів оригіналу за 3 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
6. UniProt, P07949 (англ.) . Архів оригіналу за 3 травня 2018. Процитовано 26 квітня 2018.
7. Knowles PP, Murray-Rust J. та ін. (2006). Structure and chemical inhibition of the RET tyrosine kinase domain. J. Biol. Chem. 281 (44): 33577—87. doi:10.1074/jbc.M605604200. PMID 16928683. {{cite journal}}: Явне використання «та ін.» у: |author= (довідка)
8. База даних хвороб, які пов'язані з аномаліями в RET. Архів оригіналу за 14 серпня 2021. Процитовано 28 березня 2012.
9. Arighi E, Borrello MG, Sariola H. (2005). RET tyrosine kinase signaling in development and cancer. Cytokine Growth Factor Rev. 16 (4–5): 441—67. doi:10.1016/j.cytogfr.2005.05.010. PMID 15982921.

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»