Село Болибоки знаходиться за 4 км від річки Лопань (правий берег), на відстані 2 км розташовані села Маслії, Мищенки, Замірці. Поруч із селом садові ділянки. Селом тече Балка Бармаха з декількома загатами. Поруч проходить автомобільна дорога Т 2103.
Село постраждало внаслідок геноциду українського народу, проведеного урядом СССР у 1932—1933 роках, кількість встановлених жертв у Дергачах та Болибоках — 274 особи.[4]
12 червня 2020 року, розпорядженням Кабінету Міністрів України № 725-р «Про визначення адміністративних центрів та затвердження територій територіальних громад Харківської області», увійшло до складу Дергачівської міської громади[5].
19 липня 2020 року, в результаті адміністративно-територіальної реформи та ліквідації Дергачівського району, село увійшло до складу Харківського району[6].
