アロダポスクス科の正確な位置付けはいまだ議論が続いている。Narváez et al. はアロダポスクス科をハイラエオチャンプサ科の姉妹群とし、さらにそれら2科を纏めてワニ目の姉妹群とした[1]。別の研究では、これら2科は姉妹群ではなくワニ目に至る進化的段階を示すものとして扱われ、またアロダポスクス科はハイラエオチャンプサ科よりも派生的とされた[9][8]。体骨格の情報を組み込んだ2021年の研究ではアロダポスクス科はワニ目の内部に位置付けられた[10]。
^ abNarváez, I.; Brochu, C.A.; Escaso, F.; Pérez-García, A.; Ortega, F. (2016). “New Spanish Late Cretaceous eusuchian reveals the synchronic and sympatric presence of two allodaposuchids”. Cretaceous Research65: 112–125. doi:10.1016/j.cretres.2016.04.018.
^Nopcsa F., 1928 – Paleontological notes on Reptilia. 7. Classification of the Crocodilia – Geologica Hungarica, Series Palaeontologica 1: 75–84.
^Buscalioni, A. D.; Ortega, F.; Weishampel, D. B.; Jianu, C. M. (2001). “A revision of the crocodyliform Allodaposuchus precedens from the Upper Cretaceous of the Hateg Basin, Romania. Its relevance in the phylogeny of Eusuchia”. Journal of Vertebrate Paleontology21: 74–86. doi:10.1671/0272-4634(2001)021[0074:AROTCA]2.0.CO;2.
^Martin, J. E.; Delfino, M.; Garcia, G.; Godefroit, P.; Berton, S.; Valentin, X. (2016). “New specimens of Allodaposuchus precedens from France: intraspecific variability and the diversity of European Late Cretaceous eusuchians”. Zoological Journal of the Linnean Society176 (3): 607–631. doi:10.1111/zoj.12331.