L'isola è situata nella parte centro-meridionale del mare di Barents, al centro della baia della Sajda, nella zona nordoccidentale della baia di Kola.[2] Dista dalla terraferma, nel punto più vicino, circa 235 m.[3]
Jagel'nyj si trova a nord della città chiusa di Gadžievo, poco a est dell'isola Ploskij e, per un tratto, chiude al centro il golfo Jagel'naja (бухта Ягельная).[4]
È orientata in direzione nord-sud. Ha una forma allungata irregolare, con due strozzature che formano un'insenatura a nord, sulla costa occidentale, e due al centro da ambo i lati.[4] Misura circa 930 m di lunghezza[5] e 385 m di larghezza massima[6] nella parte meridionale. A sud raggiunge un'altezza massima di 35,1 m s.l.m.[4]
Nella parte settentrionale è presente un piccolo lago.[4] Uno scoglio senza nome si trova invece lungo la costa centro-occidentale.[4]
Isola Ploskij (остров Плоский), 130 m a ovest di Jagel'nyj, è un'isola triangolare irregolare, orientata in direzione nordest-sudovest. (69°16′12″N 33°18′52″E69°16′12″N, 33°18′52″E)
Isola Domašnij (остров Домашний), 2,35 km più a sudovest, è un'isola di forma irregolare con un promontorio sul vertice nordoccidentale.[4] (69°15′18″N 33°15′34″E69°15′18″N, 33°15′34″E)
Isola Prodol'nyj (остров Продольный), 2,85 km a sudovest di Jagel'nyj, è un'isola stretta e lunga, poco a est di Domašnij. (69°14′56″N 33°15′19″E69°14′56″N, 33°15′19″E)
Isole Lesnye (острова Лесные), 3,9 km a sudovest di Jagel'nyj, sono due piccole isola tra l'imboccatura della baia Lesnaja (бухта Лесная) e il villaggio disabitato di Sajda Guba.[8] (69°15′08″N 33°13′36.4″E69°15′08″N, 33°13′36.4″E)
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