GATA4

GATA4
Visualisation de la protéine Cristallisée GATA4
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 2M9W
Identifiants
Aliases	GATA4
IDs externes	OMIM: 600576 MGI: 95664 HomoloGene: 1551 GeneCards: GATA4
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 8 humain[1] Locus 8p23.1 Début 11,676,959 bp[1] Fin 11,760,002 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 14 (souris)[2] Locus 14 D1|14 33.24 cM Début 63,436,371 bp[2] Fin 63,509,141 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans auricule droit ventricule gauche duodénum apex of heart left ovary artère coronaire droite right ovary body of pancreas artère coronaire gauche right testis Fortement exprimé dans epithelium of stomach germinal epithelium antre du pylore duodénum granulosa cell of ovary mucous cell of stomach crête génitale cellule de Leydig theca folliculi Vésicule vitelline Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison ADN sequence-specific DNA binding co-SMAD binding DNA-binding transcription factor activity transcription coactivator activity zinc ion binding transcription factor binding liaison de chromatine liaison ion métal liaison protéique cis-regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific protein kinase binding NFAT protein binding RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Composant cellulaire nucléoplasme RNA polymerase II transcription regulator complex noyau corps nucléaire Processus biologique endoderm development male gonad development regulation of transcription, DNA-templated ventricular septum development cell growth involved in cardiac muscle cell development embryonic foregut morphogenesis endocardial cushion development cardiac muscle cell differentiation cell-cell signaling response to mechanical stimulus coagulation sanguine transcription by RNA polymerase II transcription, DNA-templated positive regulation of angiogenesis régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN heart looping atrial septum morphogenesis response to vitamin A regulation of cardiac muscle cell contraction atrial septum secundum morphogenesis atrial septum primum morphogenesis intestinal epithelial cell differentiation embryonic heart tube anterior/posterior pattern specification positive regulation of BMP signaling pathway positive regulation of cardioblast differentiation positive regulation of vascular endothelial growth factor production negative regulation of autophagy cardiac ventricle morphogenesis cardiac right ventricle morphogenesis cellular response to glucose stimulus positive regulation of transcription by RNA polymerase II transdifférenciation aortic valve morphogenesis développement du cœur morphogenèse d'un organe animal histogenèse développement d'une cellule structure anatomique impliquée dans la morphogenèse digestive tract development cardiac muscle tissue development atrioventricular valve formation negative regulation of cardiac muscle cell apoptotic process regulation of protein kinase B signaling cardiac muscle tissue regeneration positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade negative regulation of oxidative stress-induced cell death negative regulation of apoptotic signaling pathway Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 2626 14463 Ensembl ENSG00000136574 ENSG00000285109 ENSMUSG00000021944 UniProt P43694 Q08369 RefSeq (mRNA) NM_001308093 NM_001308094 NM_002052 NM_001374273 NM_001374274 NM_008092 NM_001310610 RefSeq (protéine) NP_001295022 NP_001295023 NP_002043 NP_001361202 NP_001361203 NP_001297539 NP_032118 Localisation (UCSC) Chr 8: 11.68 – 11.76 Mb Chr 14: 63.44 – 63.51 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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La protéine GATA4 est un facteur de transcription codé chez l'homme par le gène GATA4[5].

La protéine GATA4 appartient à la famille des facteurs transcription GATA avec domaines en doigts de zinc. Les membres de cette famille reconnaissent le motif d'ADN GATA, qui est présent dans les promoteurs d'une multitude de gènes. GATA4 semble réguler des gènes impliqués dans l'embryogénèse et dans la différenciation et fonction du myocarde. Des mutations dans ce gène ont été associées avec des défauts du septum arteriosum[6].

Interactions

La protéine GATA4 s'est montrée être capable d'interagir avec:

• NKX2-5[7],[8],[9]
• TBX5[7]
• ZFPM2 (en)[10]
• Facteur de réponse au sérum[11],[12]
• HAND2[13]

Notes et références

1. ENSG00000285109 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136574, ENSG00000285109 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000021944 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. (en) White RA, Dowler LL, Pasztor LM, Gatson LL, Adkison LR, Angeloni SV, Wilson DB, « Assignment of the transcription factor GATA4 gene to human chromosome 8 and mouse chromosome 14: Gata4 is a candidate gene for Ds (disorganization) », Genomics, vol. 27, n^o 1,‎ octobre 1995, p. 20–6. (PMID 7665171, DOI 10.1006/geno.1995.1003)
6. « Entrez Gene: GATA4 GATA binding protein 4 »
7. Vidu Garg, « GATA4 mutations cause human congenital heart defects and reveal an interaction with TBX5 », Nature, vol. 424, n^o 6947,‎ juillet 2003, p. 443–447 (PMID 12845333, DOI 10.1038/nature01827)
8. D Durocher, « The cardiac transcription factors Nkx2-5 and GATA-4 are mutual cofactors », EMBO J, vol. 16, n^o 18,‎ 1997, p. 5687–96 (ISSN 0261-4189, PMID 9312027, DOI 10.1093/emboj/16.18.5687)
9. W Zhu, « Functional analyses of three Csx/Nkx-2.5 mutations that cause human congenital heart disease », J Biol Chem, vol. 275, n^o 45,‎ 2000, p. 35291–6 (ISSN 0021-9258, PMID 10948187, DOI 10.1074/jbc.M000525200)
10. E C Svensson, « Molecular cloning of FOG-2: a modulator of transcription factor GATA-4 in cardiomyocytes », Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 96, n^o 3,‎ février 1999, p. 956–61 (ISSN 0027-8424, PMID 9927675)
11. N S Belaguli, « Cardiac tissue enriched factors serum response factor and GATA-4 are mutual coregulators », Mol. Cell. Biol., vol. 20, n^o 20,‎ octobre 2000, p. 7550–8 (ISSN 0270-7306, PMID 11003651)
12. S Morin, « Serum response factor-GATA ternary complex required for nuclear signaling by a G-protein-coupled receptor », Mol. Cell. Biol., vol. 21, n^o 4,‎ février 2001, p. 1036–44 (ISSN 0270-7306, PMID 11158291, DOI 10.1128/MCB.21.4.1036-1044.2001)
13. Yan-Shan Dai, « The transcription factors GATA4 and dHAND physically interact to synergistically activate cardiac gene expression through a p300-dependent mechanism », J. Biol. Chem., vol. 277, n^o 27,‎ jul. 2002, p. 24390–8 (ISSN 0021-9258, PMID 11994297, DOI 10.1074/jbc.M202490200)

Liens externes

• Infobiogen