San Cebrián de Castro liegt in der kastilischen Hochebene in einer Höhe von etwa 685 m. Das Stadtzentrum der Provinzhauptstadt Zamora ist nur etwa 21 Kilometer (Fahrtstrecke) in südlicher Richtung entfernt. Der Esla begrenzt die Gemeinde im Westen. Durch die Gemeinde führt die Autovía A-66. Das Klima im Winter ist durchaus kalt, im Sommer dagegen warm bis heiß; die eher spärlichen Regenfälle (531 mm/Jahr) fallen verteilt übers ganze Jahr.[2]
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