Ptolemaios XIII Theos Philopator (bahasa Yunani: Πτολεμαῖος Θεός Φιλοπάτωρ, Ptolemaĩos Theós Philopátōr, 62 SM/61 SM–13 Januari 47 SM, berkuasa sejak 51 SM) adalah raja dari Dinasti Ptolemaik di Kerajaan Ptolemaik di Mesir. Dia adalah salah satu raja terakhir dari dinasti itu.