Sebuah hidrogenosom adalah organel tertutup membran beberapa ciliata anaerobik, Trichomonas, jamur, dan hewan. Hidrogenosom dari Trichomonas (yang paling banyak dipelajari dari mikroorganisme mengandung hidrogenosom) menghasilkan hidrogen molekul, asetat, karbon dioksida dan ATP oleh tindakan gabungan dari piruvat:feredoksin oksido-reduktase, hydrogenase, asetat: suksinat transferase CoA dan suksinat thiokinase. Superoksida dismutase, dehidrogenase malat (decarboxylating), ferredoxin, kinase siklase dan NADH: ferredoxin Oxido-reductase juga dilokalisasi di hidrogenosom. Hal ini hampir secara universal diterima bahwa hidrogenosom berevolusi dari mitokondria.[2]