Pada zaman Hindia Belanda, Kecamatan Cipayung secara administratif merupakan bagian dari gemeente Meester Cornelis yang sekarang merupakan wilayah Kecamatan Jatinegara dan bagian dari Kawedanan Kramat Jati tahun 1950-an.
Kecamatan Cipayung dimekarkan dari Kecamatan Pasar Rebo sekitar tahun 1992.
KELURAHAN LUBANG BUAYA, DENGAN KODE POS 13810
KELURAHAN CEGER, DENGAN KODE POS 13820
KELURAHAN RAMBUTAN, DENGAN KODE POS 13830
KELURAHAN CIPAYUNG, DENGAN KODE POS 13840
KELURAHAN MUNJUL, DENGAN KODE POS 13850
KELURAHAN PONDOK RANGGON, DENGAN KODE POS 13860
KELURAHAN CILANGKAP, DENGAN KODE POS 13870
KELURAHAN S€TU, DENGAN KODE POS 13880
KELURAHAN BAMBU APUS, DENGAN KODE POS 13890
Transportasi
Terdapat satu lapangan terbang di kecamatan ini yaitu Bandar Udara Wiladatika yang terletak di kompleks Buperta yang masuk dalam wilayah kelurahan Munjul.[2][3][4]
.svg){kind=small}