Giai đoạn trước năm 2000, đây là giai đoạn diễn ra một số thay đổi hành chính lớn qua đó tái lập tỉnh Bắc Ninh và một số huyện thị trong tỉnh. Thời điểm đó, tỉnh mới được tái lập nên nhu cầu phát triển kinh tế - xã hội càng trở nên cấp thiết để định hướng phát triển theo hướng công nghiệp hóa hiện đại hóa. Trong đó, sự phát triển giáo dục cũng là nhu cầu tất yếu hòa chung vào sự phát triển đó. Từ thực tế đó, tỉnh nhà cần phải mở thêm trường lớp để đáp ứng nhu cầu học tập của con em địa phương đang tăng lên từng ngày.
Giai đoạn 2000 – 2005, ngoài số trường đã tồn tại từ thời còn thuộc tỉnh Hà Bắc, UBND tỉnh Bắc Ninh đã cấp phép hoạt động cho hàng chục trường Trung học Phổ thông mới để phục vụ nhu cầu học tập của con em địa phương. Do chính sách khuyến khích xã hội hóa giáo dục của nhà nước nên trong số này đa phần là các trường Trung học Phổ thông dân lập và tư thục.
Tháng 12 năm 2008, UBND tỉnh Bắc Ninh thực hiện đổi tên đồng loạt 17 trường Trung học Phổ thông nhằm sắp xếp lại tên gọi các trường do việc mở rộng thành phố Bắc Ninh diễn ra vào năm 2007 và để chuẩn hóa theo một số quy định đặt tên trường của Bộ Giáo dục và Đào tạo lúc đó.[1]
STT
Tên trường cũ
Tên trường mới
1
Trường Trung học Phổ thông Quế Võ số 4
Trường Trung học Phổ thông Hàm Long
2
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Quế Võ
Trường Trung học Phổ thông Phố Mới
3
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Quế Võ số 2
Trường Trung học Phổ thông Trần Hưng Đạo
4
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Tiên Du số 1
Trường Trung học Phổ thông Trần Nhân Tông
5
Trường Trung học Phổ thông Tiên Du số 2
Trường Trung học Phổ thông Lý Thường Kiệt
6
Trường Trung học Phổ thông Tiên Du số 3
Trường Trung học Phổ thông Nguyễn Đăng Đạo
7
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Tiên Du số 2
Trường Trung học Phổ thông Lê Quý Đôn
8
Trường Trung học Phổ thông Yên Phong số 2
Trường Trung học Phổ thông Lý Nhân Tông
9
Trường Trung học Phổ thông Yên Phong số 3
Trường Trung học Phổ thông Yên Phong số 2
10
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Nguyễn Trãi
Trường Trung học Phổ thông Nguyễn Trãi
11
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Lương Tài
Trường Trung học Phổ thông Lương Tài số 3
12
Trường Trung học Phổ thông Tư thục Hải Á
Trường Trung học Phổ thông Hải Á
13
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Thuận Thành
Trường Trung học Phổ thông Thiên Đức
14
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Bắc Ninh số 1
Trường Trung học Phổ thông Bắc Ninh
15
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Nguyễn Du
Trường Trung học Phổ thông Nguyễn Du
16
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Gia Bình
Trường Trung học Phổ thông Gia Bình số 3
17
Trường Trung học Phổ thông Dân lập Từ Sơn
Trường Trung học Phổ thông Từ Sơn
Giai đoạn 2010 – 2011, UBND tỉnh cũng đã hoàn tất việc chuyển đổi từ trường Trung học Phổ thông Dân lập sang Tư thục đối với 11/11 trường Trung học Phổ thông Dân lập trên địa bàn tỉnh. Việc chuyển đổi trường Trung học Phổ thông Dân lập sang Tư thục nhằm tăng cường tính tự chủ, tự chịu trách nhiệm đối với các tổ chức, cá nhân trong các hoạt động giáo dục, tạo sự cạnh tranh lành mạnh giữa các cơ sở giáo dục ngoài công lập, đáp ứng nhu cầu nguyện vọng của người học.[2]
Tháng 7 năm 2012, sau nhiều năm học vất vả vì thiếu thí sinh đầu vào nên Trường Trung học Phổ thông Bắc Ninh có trụ sở ở khu 5, phường Đại Phúc, thành phố Bắc Ninh đã tuyên bố ngừng tuyển sinh, số học sinh còn lại đang theo học tại trường được bàn giao cho Trường Trung học Phổ thông Nguyễn Du ở phường Võ Cường gần đó.[3]
^Trường được thành lập tháng 11/1972 với tên gọi ban đầu là trường THPT Gia Lương số 2. Từ năm 1999, trường đổi tên là trường THPT Gia Bình số 1 như hiện nay.
^Tiền thân là trường THPT Gia Lương số 3. Sau khi tái lập huyện Gia Bình, trường được đổi tên thành trường THPT Gia Bình số 2 từ ngày 01/09/1999. Từ năm 2010, trường tiếp tục được đổi tên là trường THPT Lê Văn Thịnh như hiện nay.
^Trường được UBND tỉnh ra Quyết định thành lập từ tháng 4 năm 2005 với tên gọi ban đầu là Trường THPT Dân lập Tiên Du số 2 có trụ sở ở xã Đại Đồng, huyện Tiên Du. Đến giữa năm 2014, trường chuyển địa chỉ về tại xã Việt Đoàn theo Quyết định số 1212/UBND-TNMT do Phó Chủ tịch UBND tỉnh Nguyễn Tử Quỳnh ký ngày 05 tháng 06 năm 2014.
^Kbis là một trường phổ thông liên cấp đào tạo đa đạng các cấp học từ cấp mầm non đến trung học phổ thông. Ngoài ra, đây cũng là một trong những trường quốc tế đầu tiên ở miền Bắc đào tạo song ngữ.
^Phạm Thị Thu Thủy (ngày 15 tháng 11 năm 2014). “Lịch sử Trường THPT Lương Tài”. Trường THPT Lương Tài. Bản gốc lưu trữ ngày 1 tháng 7 năm 2019. Truy cập ngày 18 tháng 7 năm 2019.
^“Giới thiệu Trường THPT Hải Á”. Trường THPT Hải Á. ngày 14 tháng 3 năm 2019. Bản gốc lưu trữ ngày 16 tháng 1 năm 2022. Truy cập ngày 18 tháng 7 năm 2019.