Перші два випадки коронавірусної хвороби було виявлено на території Миколаївщини 12 квітня 2020 року[2]. Станом на 19 липня 2021 виявлено 70208 випадків інфікування. 1859 осіб померло (2,6 %).
До 11 квітня, незважаючи на більш ніж 1500 випадків загалом в Україні, в Миколаївській області не було офіційно зареєстровано жодного випадку. З огляду на це, заступник міністра Міністерства охорони здоров'я ініціював перевірку ситуації в області, щоб виявити, чи дійсно в області немає заражених, чи там порушено алгоритм перевірки людей[3].
На 8 квітня було госпіталізовано 9 людей з підозрою на вірус, але тестування показало, що всі вони незаражені[4].
9 квітня зранку до Миколаєва літаком прибув головний санітарний лікар України Віктор Ляшко, що планував перевірити ситуацію[5]. ЗМІ писали, що машина, яку дали головному санлікарю, врізалася в бус журналістів. Ляшко повідомив, що його в автомобілі під час ДТП не було, він тоді давав інтерв'ю журналістам.[6] Пізніше того дня він повідомив, що вірус так і не знайшли[7].
10 квітня СБУ виявила порушення під час тестування на коронавірус у Миколаєвській області, тому було заплановано повторну перевірку всіх зразків в області[8].
11 квітня в області зафіксовано перші два випадки[9].
12 квітня в області виявили три нових випадки, це контактні особи які мали спільні богослужіння з першими виявленими в області двома жінками, у яких підтвердили коронавірусну хворобу[10][11]. З неофіційних джерел стало відомо, що, як і хворі жінки-пенсіонерки, так і нині виявлені контактні, входять до релігійної громади однієї з протестантських церков.
14 квітня в області підтверджено ще 9 випадків захворювання на COVID-19[12]. Вони належать до тісного релігійного кола із інфікованими раніше, всі зареєстровані у Вознесенському районі[13].
15 квітня в області підтверджено ще 8 випадків захворювання на COVID-19[14].
23 квітня село Семенівка на Миколаївщині було закрито на в'їзд і виїзд через зростання числа інфікованих. На трасі Н-24 до села залишено працювати єдиний КПП, а проїзд дозволено виключно місцевим жителям і працівникам критичної інфраструктури за спеціальними перепустками[15]. Із 99 інфікованих, 23 — медичних працівника.[16]
19 липня в курортному селищі Рибаківка в Миколаївській області виявили спалах COVID-19[17].
З 1 вересня в Миколаєві на час карантину було вирішено частково скасувати пільговий проїзд у транспорті для всіх, окрім учасників бойових дій, співробітників МВС та ЗСУ, пенсіонерів-працівників служб соцзахисту та учнів[18]. Також в області було посилено карантин, заборонено концерти, дискотеки і роботу нічних клубів[19].
2021
21 березня в Миколаєві було введено жорсткий карантин до 4 квітня[20]. 22 березня у місцевому транспорті було введено спецперепустки для проїзду[21].
25 березня Черкаська та Миколаївська області було включено до «червоної зони» карантину, у Миколаївській області показник захворюваності сягнув 106,7 на 100 тис. населення, у Черкаській — 67,6[22].
4 квітня керівництво ринку «Колос» у Миколаєві відмовилося дотримуватися карантину, після чого входи до ринку було заблоковано нацгвардією[23].
7 квітня в Миколаєві пройшли протести проти карантину, на які вийшло близько 300 людей. Мер міста Олександр Сєнкевич заявив їм, що нічим не може допомогти[24].