Ген-кандидат

Ранжирование генов-кандидатов заболеваний на основе данных по экспрессии генов и белок-белковых взаимодействий, с использованием метода центральности узла по Кацу[1]

Ген-кандидат — ген, который может быть связан с проявлением сложного признака либо с возникновением заболевания.

Методы определения

Ряд методов даёт возможность выявить участки хромосом, ассоциированные с той или иной болезнью, генные чипы (технология microarray^[англ.]) позволяют сузить диапазон поиска, а знание функций белка, кодируемого ге́ном, и другие свидетельства, позволяют строить предположения о его возможной роли в патологическом процессе и влиянии на фенотип организма.

Области применения

При изучении сложных заболеваний с неясной этиологией, например, шизофрении и болезни Альцгеймера, в списки кандидатов зачастую попадают десятки генов.

Поиск генов-кандидатов и их дальнейшее использование в выявлении генетических ассоциаций^[англ.] являются также неотъемлемой частью генетических исследований в других областях биологии и на сельскохозяйственных видах[2][3].

Базы данных

Созданы сайты, содержащие базы данных по генам-кандидатам сложных расстройств и заболеваний:

• Форум исследования болезни Альцгеймера
• Форум исследования шизофрении

Примечания

1. Zhao J., Yang T.-H., Huang Y., Holme P. Ranking candidate disease genes from gene expression and protein interaction: a Katz-centrality based approach (англ.) // PLoS One : журнал. — San Francisco, CA, USA: PLOS, 2011. — Vol. 6, no. 9. — Article e24306. — ISSN 1932-6203. — doi:10.1371/journal.pone.0024306. — PMID 21912686. Архивировано 15 августа 2020 года. (Дата обращения: 2 ноября 2020)
2. Dunn I. C., Miao Y.-W., Morris A., Romanov M. N., Wilson P. W., Sharp P. J. (1999-10-06). "The detection and assay of polymorphism in candidate reproductive gene loci in a commercial broiler breeder population for association studies". Proceedings. Poultry Genetics Symposium (Mariensee, 6—8 October 1999). Mariensee, Germany: Working Group 3 of WPSA. p. 113. Архивировано из оригинала 23 октября 2020. Дата обращения: 23 октября 2020. (англ.)
3. Dunn I. C., Miao Y.-W., Morris A., Romanov M. N., Waddington D. W., Wilson P. W., Sharp P. J. (2001-04-11). "Association between candidate genes and reproductive traits in a commercial broiler breeder population". Proceedings. Spring Meeting of the United Kingdom Branch of the World’s Poultry Science Association (York, 11—12 April 2001). York, UK: World Poultry Science Association, UK Branch. pp. 42—43. Архивировано из оригинала 2 ноября 2020. Дата обращения: 2 ноября 2020. (англ.)