Após a rendição da Alemanha aos Aliados, foi emitida ordem a todos os submarinos para se entregarem. Rolf Werner Wentz não acatou as ordens, e ao invés, rumou a Portugal, país neutro, e no qual demorou 8 dias a percorrer os 4500km que separam o mar da Irlanda da costa Nazarena. Após chegarem, no dia 20 de maio de 1945, 3 tripulantes foram a terra num bote de borracha contactarem com as autoridades marítimas, informando que o submarino iria ser afundado e que já estava naquele momento com água aberta, e pedindo para os tripulantes serem recolhidos do submarino. Uma embarcação da Capitania foi ao encontro do submarino e resgatou os tripulantes e o comandante. Por volta das 10h30 da manhã, o U-963 afundou-se a sul sudueste a cerca de 500 metros do farol da Nazaré. Toda a tripulação (48 homens) foi acolhida em Portugal e foi finalmente transferida para cativeiro britânico[6].
Os destroços jazem a uma profundidade aproximada de 110 metros, a cerca de 500 metros a sul sudoeste do farol, junto ao canhão da Nazaré. Em 2004 a presença dos destroços foi confirmada através de sonar de varrimento lateral, e onde se pôde constatar através das imagens de sonar que o submarino jaz tombado sobre o seu lado direito, e aparentando estar em bom estado apesar da torre de comando se ter separado do casco do submarino, jazendo a poucos metros de distância. Duas tentativas de alcançar os destroços por meio de um submersível tripulado foram feitas, e apesar de na ultima tentativa, o submersível ter estado a menos de 15 metros do U-963, o contacto não foi possível devido à grande turbulência e suspensão de sedimentos presentes no local.
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Blair, Clay (1996). Hitler's U-boat War. The Hunters, 1939-1942 (em inglês). New York: Random House. 774 páginas. ISBN0394588398
Blair, Clay (1998). Hitler's U-boat War, Vol II (em inglês). New York: Random House. 820 páginas. ISBN0679457429
Jürgen, Rohwer; Gerhard Hümmelchen (1992). Chronology of the war at sea 1939-1945 : the naval history of world War Two (em inglês) 2ª ed. Annapolis, Maryland (USA): Naval Institute Press. 432 páginas. ISBN155750105XA referência emprega parâmetros obsoletos |coautor= (ajuda)
Niestle, Axel (1998). German U-Boat Losses During World War II (em inglês). Annapolis, Maryland (USA): Naval Institute Press. 160 páginas. ISBN1557506418
Sharpe, Peter (1998). U-Boat Fact File (em inglês). Inglaterra: Midland Publishing. 224 páginas. ISBN1857800729
Stern, Robert Cecil (1991). Type VII U-boats (em inglês). Annapolis, Maryland (USA): Naval Institute Press. 160 páginas. ISBN1557508283
Whitley, Michael J (1988). Destroyers of World War Two : an internat. encyclopedia. (em inglês). Londres: Arms and Armour Press. 319 páginas. ISBN0853689105
Wynn, Kenneth G (1998). U-Boat Operations of the Second World War - Vol 1 (em inglês). Annapolis, Maryland (USA): Naval Institute Press. 368 páginas. ISBN1557508607
Wynn, Kenneth G (1998). U-Boat Operations of the Second World War - Vol 2 (em inglês). Annapolis, Maryland (USA): Naval Institute Press. 336 páginas. ISBN1557508623
Ligações externas
«U-boat Archive» (em inglês). Consultado em 31 de janeiro de 2014