ハプログループR (mtDNA)

R 系統

系統祖	{{{major-haplo}}}
発生時期	66.8±14.2 kya ^[1]
発生地（推定）	西南アジア？
親階層	N
分岐指標	12705, 16223^[2]
子階層	R0, R1, R1b, R2'JT, R3, R5, R6'7, R8, R9, R11'B, R12'21, R14, R22, R23, R30, R31, P, U

ハプログループR (mtDNA) はユーラシアを中心に広く分布するミトコンドリアDNAハプログループである。このグループは約70,000年前の出アフリカ後の移住に関連している^[3]。ハプログループNを親系統に持ち、B、F、R0、JTなどの子系統を生み出した。

起源と分布

Soares et al. (2009)はハプログループRの誕生を66.8±14.2 kya (95% CI)^[1]（およそ80,000 - 50,000年前、おそらく65,000年前）と推定した。

このグループの分布は、現生人類の東アフリカから西、南、東南アジアへの移住と一致する^[4]。およそ70,000年から60,000年前の間に、ハプログループM、N、およびRの初期の下位系統が出現したと考えられる^[5]。特に南アジアの先住民で幅広い多様性と古さを示しており、インド西部と南部のトライブとカーストは他の地域よりも多様性が高く、おそらく彼らの自生の地位を示唆している^[6]。シベリアのウスト・イシム人はハプログループR*に属している^[7]^[8]。

ハプログループRとその子孫は、オーストラリア、南北アメリカ、東南アジア、南アジア、中央アジア、西アジア、東アジア、ヨーロッパ、北アフリカ、アフリカの角に分布しているが、パラグループR*は、ソコトラ（1.2％）、北東アフリカ（1.5％）、中東（0.8％）、近東（0.8％）、アラビア半島（0.3％）に見られる^[9]ため、このあたりが発祥地と考えられる。

ヒトのミトコンドリアDNAハプログループの系統樹

ミトコンドリア・イブ (L)

M

N

D

G

Q

A

O

S

X

R

C

Z

E

I

W

Y

B

P

U

F

J

T

K

H

V

脚注

^ ^a ^b Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Röhl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen et al. (2009). “Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock”. The American Journal of Human Genetics 84 (6): 740–59. doi:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.
^ Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009). “Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation”. Human Mutation 30 (2): E386–94. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457.
^ Larruga, Jose M (23 May 2017). “Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup R colonized Eurasia and Australasia from a southeast Asia core area”. BMC Evolutionary Biology 17 (1): 115. doi:10.1186/s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779.
^ Karmin, Monika (2005). Human mitochondrial DNA haplogroup R in India: dissecting the phylogenetic tree of South Asian-specific lineages (M.Sc. Thesis). University of Tartu. hdl:10062/567. OCLC 692161090 ^{[要ページ番号]}
^ Palanichamy, Malliya Gounder; Sun, Chang; Agrawal, Suraksha; Bandelt, Hans-Jürgen; Kong, Qing-Peng; Khan, Faisal; Wang, Cheng-Ye; Chaudhuri, Tapas Kumar et al. (2004). “Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India, Based on Complete Sequencing: Implications for the Peopling of South Asia”. The American Journal of Human Genetics 75 (6): 966–78. doi:10.1086/425871. PMC 1182158. PMID 15467980.
^ Maji, Suvendu; Krithika, S.; Vasul, T.S. (2008). “Distribution of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India with Special Reference to Haplogroup R and its Sub-Haplogroup U”. International Journal of Human Genetics 8 (1–2): 85–96. doi:10.1080/09723757.2008.11886022.
^ Marrero, Patricia; Abu-Amero, Khaled K; Larruga, Jose M; Cabrera, Vicente M (2016). “Carriers of human mitochondrial DNA macrohaplogroup M colonized India from southeastern Asia”. BMC Evolutionary Biology 16 (1): 246. doi:10.1186/s12862-016-0816-8. PMC 5105315. PMID 27832758.
^ Larruga, Jose M; Marrero, Patricia; Abu-Amero, Khaled K; Golubenko, Maria V; Cabrera, Vicente M (2017). “Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup R colonized Eurasia and Australasia from a southeast Asia core area”. BMC Evolutionary Biology 17 (1): 115. doi:10.1186/s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779.
^ Černý, Viktor (2009). “Out of Arabia—the settlement of island Soqotra as revealed by mitochondrial and Y chromosome genetic diversity”. American Journal of Physical Anthropology 138 (4): 439–447. doi:10.1002/ajpa.20960. PMID 19012329. オリジナルの6 October 2016時点におけるアーカイブ。 13 June 2016閲覧。.

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